专为蛋白设计，有效提高蛋白检测灵敏度，增加电荷数目，避免堵针，提高稳定性
仅FTMS能胜任。
200,000
Orbitrap为外标2ppm,内标1ppm；
灵敏度MS
ESI: Reserpine100fg S/N>100:1S/N>100:1（同时保持高分辨率）
ESI:Ubiquitin S/N>10:1for<100 amol(consumed)
针对复杂样品：FTMS因为拥有In-cell isolation，in-cell accumulation、CASITM等功能可选择性富集目标离子，因此大大提高了低丰度目标物检出限；
仪器指标20 amol为LTQ或Velos检测限。
离子传输
双重离子漏斗（Dualfunnel）
双重离子漏斗（Dualfunnel）
MS/MS技术
middleband CID
CID,QCID,ECD,SORI,ETD(可选)
CID,HCD，后置ETD
离子确度
一次校正，即可同时对一级，二级质谱校正，外标法<2ppm，内
性能指标
Compact QTOF
FT-ICR-MSSolariX7T
Orbitrap
质量范围
（m/z）
20–40,000m/z
Q1四极杆前体离子隔离范围：3,000m/z
TOF范围：20-40,000
100–10,000m/z
Q1四极杆前体离子隔离范围：100-6,000m/z
FTMS可分析诸如IgG等分子量150000以上的蛋白质
标法<0.8ppm
月偏差不超过5 ppm
周偏差不超过5 ppm
动态范围
5个数量级
5个数量级
3-3.5个数量级
CryoSpray冷源
有，专为测定热不稳定化合物设计
有，专为测定热不稳定化合物设计
CaptiveSpray
nanoBooster
离子源
专为蛋白设计，有效提高蛋白检测灵敏度，增加电荷数目，避免堵针，提高稳定性
50–4000 m/z
Orbitrap因前端Velos的限制，仅适合分子量30000以下蛋白质的分析
一级分辨率
保持全灵敏度的条件下23,000，且不影响扫描速度及质量精度。
m/z 400(lincomycin)>1,000,000
准确度高：外标小于1 ppm,内标为0.5 ppm；
在分析石油组等高复杂样品时，