2001年6月日本正式实施了中央政府管理机构的重大改革，将内阁中的部委数由原来的23个归并为15个。

1、总理府（首相办公室）、冲绳开发厅和经济企画厅合并为内阁府（内阁办公室）；
2、总务（管理与协调）、自治（内务）省和邮电省的一部分，合并为一个总务省；
3、邮电省的其余部分改为邮政事业厅；
4、文部省和科学技术厅合并为文部科学省；
5、厚生省的一部分与劳动省合并为厚生劳动省；厚生省的另一部分加上原通商
产业省的一部分，再加上环境厅，合并为环境省；
6、运输省、国土厅、北海道开发厅和建设省合并为国土交通省；
7、通商产业省改为经济产业省；
8、国家安全委员会、防卫厅、法务省、外务省、农林水产省原名称不变；
9、原大藏省改称财务省，职能也有所调整；
10、在此次改革前，已在2000年7月由原金融再生委员会转而成立的金融厅，
现继续作为内阁中的一个副省级机构，下辖日本证监会。

11、2007年即平成19年1月9日防卫厅→防卫省。