当前位置:文档之家› 第七章数量性状遗传参数估测

第七章数量性状遗传参数估测


bOP=1/2(VA /σ2P )=1/2( VA /VP )= 1/2 h2 子代对双亲均值的回归 COVOP = COVG(OP)=∑A(A+R)/ N = VA bOP = VA / VP = h2
h2 = 2bOP
②上下代方差相同,子代两性间方差不相同。 需分别求女儿和儿子对亲本的回归,并 经矫正后计算遗传力。
重复力的用途
• 3. 判断遗传力估计是否正确 • re = (VG+VEg)/ VP H2 = VG/ VP h2 = VA/ VP • re > H2 > h2 重复力是遗传力的上限。 • 4. 综合评定畜禽育种值 • 2 VA n VA n h2 h (n) = · = = • VP(n) 1+(n-1)re VP 1+(n-1)re • • • • 根据n 次度量记录,评定个体育种值: 2 AX= ( Pi - P ) h (n) + P n h2 A X = ( Pi - P ) + P 1+(n-1)re
遗传力的估计原理
• 亲缘个体为同卵双胞胎或自交后代
• • • • • • h2=rP(MT)/rA(MT) =rP(MT)/1= rP(MT) h2=rP(OP)/rA(OP) =rP(OP)/0.5= 2rP(OP)
• 亲缘个体为亲子关系 亲缘个体为全同胞关系
h2=rP(FS)/rA(FS) =rP(FS)/0.5= 2rP(FS)
第三节 重复力
• 重复力的概念 • 遗传参数(Genetic Paramenters)是反映数量 性状遗传规律的参考常数。主要有重复力、 遗传力和遗传相关。 • 重复力(Repeatability)是数量性状多次度 量值之间的重复程度。从统计学来看,是性 状各次度量值间 的组内相关系数(Intraclass correlation coefficient)。其取值在0~1之间。
环境方差的剖分
• 一般环境方差(General environmental variance): • 在时间上持久 或空间上非局部的条件所造成的环境方 差,是个体间方差的 一部分。 • VE = VEg+ VEs σ2B = VG+ Veg • 特殊环境方差(Special environmental variance) • 是暂时的或局部的条件造成的环境方差, • 是个体内方差。 σ2W = VEs
h2 =2 r(FS)
当每头公畜与配母畜数相同,每头母畜子女数相同时: σ2W = MSW 当公畜与配母畜数不同,每头母畜的子女数不同时: σ2W = MSW σ2S =〔MSS - ( σ2W -n’0 σ2D )〕/ dn0 σ2D = (MSD-MSW)/n0 ∑(∑n2/dn) n0 = D -S
亲缘个体为全同胞关系
h2=rP(HS)/rA(HS) =rP(HS)/0.25= 4rP(HS)
遗传力的估测
• • • • • • • • • • • • • 1 由亲子关系估测遗传力 ----亲子回归法(Offspring-Parent regression) ①上下代方差相同,两性间方差也相同。 子代对一个亲本的回归 bOP = COVOP/σ2P 由于∑AR=0 COVOP=COVG(OP)=∑1/2A(A+R)/ N ∴ COVG(OP)= 1/2∑A2 / N = 1/2VA h2 = 2bOP
重复力概念
• 某一性状在多个家畜中进行多次度量,同一个 体多次 度量值间 的差异称为个体内(组内) 方差 (inter-individual variance), • 不同个体间多次度量值的差 异称为个体间(组 间)方差(intra- individual variance)。 •

VP= σ2B+ σ2W
遗传力的表达方式
• 1遗传力是育种值对表型值的决定系数。 h2 = dPA = σA2 / σP 2 • 2 表型各组分间无相关时,遗传力是育种值对表型值的回归系数。 • • A = h2 P 即 h2 = bAP ∵ ∑SPAR = 0 h2 = σ2A/ σ2P=SSA/ SSP =(SSA+SPAR)/ SSP = SPAP / SSP = bAP
遗传力的应用
• 1. 预测选择效果: 通过对亲代的选择,来预测下一代可能获得的 遗传进展 。 R = S h2 • 2. 确定选择方法:对遗传力高的性状,采用个体(表型)选择 (Individual selection)。遗传力低的性状,且家系中个体表型相 关程度低,采用家系选择(Family selection)—根据家系平均值 高低选择。遗传力低的性状,且家系中个体表型相关程度高,采 用家系内选择(Within-family selection)—每个家系中选择最好者。 • 3.估计个体育种值: AX= (PX - P ) h2 + P • 4. 制订选择指数: 单个性状选择时主要根据合并选(Combined • selection index)选择,就是家系均值和家系内偏差分别用各自 • 的遗传力进行加权。 • I’= Af + Aw = h2f Pf + h2w Pw
遗传力的估测
• ②全同胞相关(Full-sib correlation)法 全同胞相关( ) COV(FS) • σ2 S + σ2 D • r(FS)= = =1/2h2 • σ2S+ σ2D+ σ2W σ2 P
• • • • σ2S =(MSS-MSD)/dn0 σ2D = (MSD-MSW)/n0
遗传力的应用
• 进行多个性状选择时,需制订综合选择指数(Comprehensive selection index):对所选性状的选择指数进行经济加权后,配合 出一个综合指数。 • 5 .作为引种时的参考: • 当用父系半同胞法估测的遗传力比明显一般均值时,说明公畜间 的差异较小,每代的选择效果不好,需从外引入公畜。 • 6. 确定繁育方法: • 对遗传力高的性状,且品种或品系内个体差异较大,一般采 • 用 纯种繁育(pure breeding)来提高生产性能。遗传力高,但品 • 系或品种内差异较小,一般采用品种或品系间杂交,基因重组 • 后再进行选择。对于遗传力低的性状,主 • 要是通过杂交来获得杂种优势。
• 3 遗传力是育种值与表型值的相关系数的平方,是用表型值估计 育种值准确性的度量。 • SPAP σP σP 1 • rAP = COVAP/ σAσP = · = bAP · = h2 · =h • SSP σA σA h • •
h2 = r2AP
遗传力的估计原理
• • • • • • • 只有通过亲属关系才能估计遗传力. rA 亲属间没有环境相关, R1 A1 A2 R2 基因型值与剩余值无相关,则 h h P1和 P2个体间的相关系数 rP=hrAh=h2rA h2=rP/rA 根据不同的亲缘关系, 可计算出遗传力. P1 rP P2
重复力估测
• VG+VEg VG+VEg σ2 B re = = = • VP VG+VEg+Ves σ2B+ σ2W • MSB-MSW ( MSB估计的是 σ2W+nσ2B) = • MSB+(n-1)MSW ( MSW估计的是 σ2W) • MSB=SSB/dfB
k
MSW =SSB/dfW
• SSB =n∑(Xj-X)2 • • • • • dfB = K-1
重复力的用途
• 1 确定性状度量次数 • 每次度量值中VG+VEg不变,只有VES改变,度量次数越多,VES越 小。 VP(n)=VG+VEg+VE s/ n • • • • • • • • ∵ VP=VG+VEg+VE s ∴ VP= re VP +VE s re=( VG+VEg)/ VP VE s = (1-re )VP
重复力的用途
• 5 根据早期的记录估测后期的产量 重复力的大小反映不同度量值间的重复程度,对于重复力高的性 状,早期产量高的个体,其后期的产量也高,早期产量低,后期 产量也低。 • 根据不同次记录与所有记录平均数的相关系数,确定用那一次记 录来估测后期产量最可靠。 • COVPiP σ2Pi σPi Vpi 1-(n-1)ri • rPi P = = = = = • σPi σP σPi σP σP VP(n) n • • • • • rPjP = 1-(n-1)rj n Q= rPi P rPjP = 1-(n-1)ri 1-(n-1)rj
kn
SSW =∑ ∑ (Xji-Xj)2 dfP = nK-1
k
n
SSP=SSB+SSW dfP=dfB+dfW i = n j= k K是个体数 n 是度量次数
dfW = K(n-1)
SSP =∑(Xji-X)2
当个体间度量次数不等时,用加权平均数 度量n0 1 n0 = ( ∑njk-1 ∑n2j ∑nj )
Q..>1时,用 第I次度量值估测准确。 Q<1 时,用第j次度量值估测准确
第四节 遗传力
• 遗传力的概念:
• 1 广义遗传力 广义遗传力(heritability in the broad sense)数量性 状基因型方差占表型方差的比率。H2=VG/VP。 • 2 狭义遗传力 heritability in the narrow sense)数量性 狭义遗传力( • 状育种值方差占表型方差的比率。h2=VA/VP。 • 3 已实现的遗传力 已实现的遗传力(realized heritability)子代选择 • 反应占亲代选择差的比例。
重复力的用途
• 2 估计个体的可能生产力: • PX = re(n)(P(n) - P ) + P
• re(n) = (VG+VEg )/ VP(n)= (VG+VEg )/ VP〔1+(n-1) re〕/ n
相关主题