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抗体库富集实验步骤

纳米抗体库富集步骤:
1)抗原包被、宿主菌接种:取30μg抗原,溶解到1ml包被缓冲液(pH=9.6)中,加入到Maxisorp免疫试管(Thermo Nunc)中,4℃静置12h;
从平板上挑取一个TG1单菌落至10ml 2×TY培养基中,37℃摇床摇过夜,次日重新1:100接种用于筛库;
2)封闭:免疫试管PBST、PBS分别清洗5次,3% BSA 3ml加入到免疫试管中,于混合器上缓慢滚动封闭2h;
3)准备宿主菌:过夜菌以1:100的比例提前2.5h(相对于第六步侵染)重新接种于新鲜的2×TY中,于37℃摇床扩增培养,保证在第6步侵染时OD600达到0.4~0.6(大肠杆菌OD600=1.0,大肠杆菌浓度为109/ml左右);
4)加抗体库:免疫试管PBST、PBS分别清洗10次(每次洗液需静置几秒钟),加入500μl原抗体库+500μl3% BSA,微量振荡器上室温剧烈滚动1h,然后室温静置1h;
4)酸洗脱:免疫试管PBST、PBS分别清洗10次(每次洗液需静置几秒钟),尽量倒干管内液体,以免残留液影响到下一步洗脱液的pH值,而影响洗脱效果;
洗脱液10mM的HCl(pH=2.0)800ul(应少于抗原包被量)加入到免疫试管中,室温剧烈震荡30min后,将洗脱液转移到到无菌的50ml离心管中,用260μl Tris-HCl(pH=8.0)中和至pH值7.0左右),大约可以洗脱106~8个纳米抗体噬菌体;
5)侵染TG1:向上所得洗脱液中加入5ml新鲜的TG1(OD600=0.4~0.6),混匀后,37℃静置40分钟,然后将侵染液稀释1000倍(取侵染液1μl加入到1ml的2×TY液体培养基中),然后分别取10μl、50μl稀释液分别涂布于Amp平板上(同时进行阳性和阴性对照),平板倒置于37℃孵箱内孵育过夜,根据平板上的细菌数目计算从免疫试管上洗脱下来的噬菌体的数目;
6)M13K07侵染:剩下的侵染液加入5ml新鲜的2×TY于37℃摇30分钟,然后加入5μl 的M13K07(约1011个噬菌体),37℃放置1h,4500rpm室温离心10分钟,弃上清,沉淀重悬于50ml新鲜的2×TY培养基中,加Amp至100ug/ml,Kan至50ug/ml,葡萄糖加至1%,30℃,200rpm摇16-20h;
7)纯化富集抗体库:将过夜菌转移到无菌50ml离心管内,4800rpm,4℃离心20分钟,上清液转移到新管中,按照1/5的体积比例加入40%PEG 4000&2.5 M NaCl 液,强烈震动后冰浴30分钟。

4800rpm,4℃离心20分钟,弃上清,沉淀重悬于1ml无菌PBS缓冲液中,然后再于12000rpm,室温离心5分钟,取上清,即为筛选第一轮的抗体库;
8)滴度测定:OD268进行滴度测定,当OD268=1.0时,噬菌体的浓度为5×1012个/ml;
9)第2、3、4、5轮次,可以按照以上步骤重复。

Nunc孔筛选与免疫试管筛选操作上的不同:
(1)包被:先于37℃包被1h,然后于4℃包被过夜(250ul/孔);
(2)封闭:分两步封闭,先是乙醇胺活性位点封闭,然后再BSA等非活性位点封闭;
(3)清洗:在BSA封闭之前都只能用PBS清洗孔,BSA封闭完后再用PBST,
因为PBST中的活性剂TWEEN可能会影响Nunc孔的化学结构.
注:因为考虑到TG1是没有任何抗性的,所以在每一次筛选涂板计数的同时平行做阳性对照及阴性对照:
阳性对照:即从VHH原库(约有1011个噬菌体)中取1ul,在2×TY中稀释1000倍,取1ul稀释液(约有108个噬菌体)侵染TG1后取适量涂Amp平板,以检验TG1宿主菌是否具有侵染能力及状态是否良好,以便判断问题的所在;
阴性对照:直接取适量TG1菌液涂于Amp平板和Kan平板,以便于观察是否被污染.。

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