研究设计
57 例 剔 除 ： 8 例 腺 鳞 癌、 13 例其他肿瘤、 17 例 SCLC 、 19 例 取 样前用过TKI
1219 例 剔 除 ： 门 诊丢失资料或合并 其他肿瘤
基因分析 N=1800
581例 组织学 证实肺癌
524例入选：腺癌354 例、鳞癌144例、大细 胞癌26例学证实肺癌
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
组织分型与驱动基因的关系
组别 AC SCC LCC 组别 AC SCC LCC EGFR 40.3% (140/347) 4.4% (6/144) 3.8% (1/26) c-Met 4.5% (14/308) 5.2% (6/116) 0.0% (0/24) PTEN 7.0% (8/115) 10.6% (10/94) 27.3% (3/11) PIK3CA 4.2% (13/307) 5.8% (7/121) 0.0% (0/24) STK11 8.6% (5/58) 6.1% (2/33) 10.0% (1/10) BRAF 2.3% (7/307) 0.0% (0/121) 0.0% (0/24) ALK 7.7% (10/130) 4.1% (4/93) 8.3% (1/12) DDR2 0% (0/97) 3.3% (2/61) 0% (0/8) KRAS 7.1% (24/340) 1.5% (2/132) 3.8% (1/26) FGFR2 0% (0/96) 1.6% (1/61) 0% (0/8)
突变NSCLC患者的标准一线治疗
TKI耐药与KRAS突变、T790M突变和MET基因扩增有关
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研究目的
广东省人民医院肺癌突变研究项目(Guangdong General
Hospital Lung Cancer Mutation Project，GGHLCMP) 目的是研究烟草消费和组织学类型对驱动基因发生率的影 响，确定富含驱动基因的亚组人群
外显子19+21 外显子18 外显子20+21 外显子20 外显子21 外显子19
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基因突变特征(一)：EGFR (N=147)
外显子/区域 外显子18 外显子19 外显子20 外显子21 外显子19+21 外显子20+21 例数 3 68 11 57 3 5 主要激活突变或氨基酸变化 G719A,G719V,G719D E746–A750缺失,E746–S752缺失,L747– A750(751,753)缺失 T790M,R776H L858R,L858M,L861R 合并外显子19缺失和外显子21L858R 合并外显子20T790M和L858R,R776H和L858R
研 究 的 驱 动 基 因 谱 包 括 中 国 原 发 性 肺 癌 患 者 EGFR 、
KRAS 、 c-Met 、 PIK3CA 、 BRAF 、 STK11 、 PTEN 、
EML4-ALK融合基因、 DDR2和 FGFR2 基因
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患者特征 (n=424)
变量 性别 年龄(岁) 组别 男 女 平均 例数(%) 361(68.9) 163(31.1) 59.3
范围
是否吸烟 组织学状态 否 是 AC
23–88
292(55.7) 232(44.3) 354(67.6)
SCC
LCC 分期 I II III IV 随访状态 生存 死亡
S伴SCC
组别 NS伴AC S伴AC NS伴SCC S伴SCC
2.1%(2/94)
c-Met 4.8%(10/207) 4.0%(4/101) 2.8%(1/36) 6.3%(5/80)
16.1%(10/62)
PIK3CA 5.2%(11/210) 2.1%(2/97) 2.6%(1/38) 7.2%(6/83)
DDR2、FGFR2突变仅见于不吸烟者
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吸烟状态对 EGFR、KARA、STK11、PTEN的影响
50
不吸烟
40.9
基因突变发生率(%)
40 30 20 12.4 10 7.8
吸烟
13.2
13.0
3.6
EGFR KRAS
6.3 2.1
STK11 PTEN
0.8
P=0.328
累积生存
0.6
0.4
0.2
0.0 0.0 20.0 40.0 60.0 总生存时间 (月)
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包括EGFR、KRAS、 ALK 、 ERCC1 、 β- 微 管 蛋 白 、 RRM1 或 cMet
检测以下基因的变化： EGFR、KRAS、cMet、PIK3CA、BRAF、 PTEN、 ALK、FGFR2、 DDR2和STK11
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基因突变特征(二)
基因 外显子/区域 例数 主要激活突变或氨基酸变化 M125–Y126缺失,S59缺失,S69X,L9–S213 缺失 C71F,N91K,Q298X,Y68H
STK11
PTEN
外显子1–5
外显子1–9
8
21
KRAS
合计
密码子12
0.8
NS伴SCC S伴SCC p=0.680
累积生存
0.6
0.4
0.2
0.0 0.0 20.0 40.0 60.0 80.0 100.0 120.0
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
总生存时间 (月)
生存分析： 不同EGFR突变状态生存期相当
1.0
EGDR阳性 ERFR阴性 N 147 370 MST(月) 69.3 69.1
8.3%(2/24)
BRAF 1.9%(4/210) 3.1%(3/97) 0.0%(0/38) 0%(0/94)
6.5%(4/62)
DDR2 0.0%(0/71) 0.0%(0/26) 0.0%(0/16) 4.4%(2/45)
2.3%(2/88)
FGFR2 0.0%(0/70) 0.0%(0/26) 0.0%(0/16) 2.2%(1/45)
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吸烟状态与组织学分型和 驱动基因突变频率的关系
组别 NS伴AC S伴AC NS伴SCC EGFR 49.8%(114/229) 22.0%(26/118) 8.0%(4/50) PTEN 9.1%(7/77) 2.6%(1/38) 0.0%(0/32) STK11 2.7%(1/37) 19.0%(4/21) 0.0%(0/9) ALK 9.3%(8/86) 4.5%(2/44) 0.0%(0/35) KRAS 4.5%(10/223) 12.0%(14/117) 0.0%(0/44)
基于组织学类型和吸烟状态对非小细胞肺癌 患者驱动基因分析
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
研究背景
肺 癌 驱 动 基 因 包 括 EGFR 、 KRAS 、 BRAF 、 PIK3CA 和 EML4-
ALK。肿瘤的产生与进展与这些基因有关
其他基因包括STL11、PTEN、DDR2和 FGFR2等 靶向作用的 EGFR-TKI ，包括厄洛替尼和吉非替尼已成为伴 EGFR
DDR2
FGFR2
1.2%(2/166)
0.6%(1/165)
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0 0
23例EGFR突变的患者同时伴c-MET扩增或STK11、PIK3CA、BRAF或PTEN突变
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
吸烟状态对驱动基因突变频率的影响
组别 NSCLC 不吸烟 吸烟 组别 NSCLC 不吸烟 吸烟 EGFR 28.4% (147/517) 40.9% (119/291) 12.4% (28/226) c-Met 4.5% (20/448) 4.3% (11/255) 4.7% (9/193) PTEN 9.5% (21/220) 6.3% (7/112) 13.0% (14/108) PIK3CA 4.4% (20/452) 4.6% (12/260) 4.2% (8/192) STK11 7.9% (8/101) 2.1% (1/48) 13.2% (7/53) BRAF 1.5% (7/452) 1.5% (4/260) 1.6% (3/192) ALK 6.3% (15/239) 6.4% (8/125) 6.1% (7/114) DDR2 1.2% (2/166) 0% (0/91) 2.7% (2/75) KRAS 5.4% (27/498) 3.6% (10/279) 7.8% (17/219) FGFR2 0.6% (1/165) 0% (0/90) 1.3% (1/75)
7.1
1.5
3.8
7.0
EGFR AC SCC LCC 40.3 4.4 3.8
KRAS 7.1 1.5 3.8
PTEN 7.0 10.6 27.36
腺癌患者 EGFR、 KRAS 突变率最高 (P 分别为 0.0005 和 0.039)大细胞癌患者 PTEN突变 率最高 (P = 0.084)
注：AC:腺癌；SCC：鳞癌；LCC：大细胞癌
Байду номын сангаас
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