一、人类基因组作图
1、遗传图(genetic mapping)/连锁图(linkage map) 通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率， 确定连锁标志在染色体上的线性排列顺序及其 相对遗传距离 距离单位：厘摩(cM)，1cM表示每次A序列 (Large Scale DNA Sequencing)
1. 基于BAC连续克隆系的测序 2. 全基因组的“鸟枪法”（shotgun）测序 3. cDNA测序 三、DNA序列的生物信息学分析（Bioinformatics
Analysis of DNA Sequences）
二、研究内容
1、鉴定DNA序列中的基因。 2、确定基因功能。
（1）利用同源搜索分析基因功能。因表达的时空性
➢ 转录组(transcriptome)：指一个细胞内的一套mRNA转 录物，包含了在某一环境条件、某一生命阶段、某一 生理或病理（功能）状态下，生命体的细胞或组织容
❖结构基因组学（structural genomics）：通过基 因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定 位的科学。
❖功能基因组学（functional genomics）：利用 结构基因组学提供的信息，进行基因和非基因序 列功能的研究。
2、物理作图（physical mapping）：
❖确定遗传标志间的物理距离，一般用bp/kb/Mb表示。 ❖1cM的遗传距离大致上相当于1Mb的物理距离。 （1）荧光原位杂交图（FISH map） （2）限制性酶切图（restriction map） ：
➢ 选用合适的限制性核酸内切酶对基因组DNA或部分基因组DNA进 行酶切，获得n genome project, HGP）：一项多国合作的国际研究计划，旨在 阐明人类基因组DNA 3×109bp的序列，发掘所 有人类基因，确定其在染色体上的位置，从而 破译人类的全部遗传信息。HGP还对包括大肠 杆菌、酵母、线虫、果蝇、拟南芥和小鼠等在 内的一系列模式生物体基因组的测序。
❖生物芯片（DNA芯片、蛋白质或肽芯片等 ❖二维蛋白质凝胶电泳（ 2-DGE） ❖飞行质谱 牛牛文档分享第二节 结构基因组学
（Structural Genomics）
➢物理制图 ➢遗传制图 ➢基因组DNA序列测定：
限制性片段长度多态性（RFLPs）、随机引物扩增多态性 (RAPD) 、扩增片段长度多态性(AFLP)
❖第二代DNA标志：
可变数目串联重复序列（VNTRs；又称小卫星）、短串联 重复序列（STRs；又称微卫星, MS）
❖第三代DNA标志H map） （4）连续克隆系（clone contig）图：是最重要的一种。
➢ 序列标签位点(sequence tagged sites, STSs): 在染色体上定位明确， 而且可用PCR扩增的单拷贝序列，基因组(genome)：泛指一个细胞或一个生物体 的全部遗传信息。在真核生物，基因组是指一套 （单倍体）染色体DNA。
基因组学(genomics)：从基因组水平（分子整 体水平）研究遗传的学科。主要是发展和应用 DNA制图、测序新技术及计算机程序，分析生命 体全部基因组的结构及功能。
一、“基因病” ( Gene Disease)的概念
1、单基因病：是指某种疾病的发生主要由一对等位 基因的一个或两个基因位点存在缺陷而引起，其 遗传方式遵循孟德尔遗传规律。
2、多基因病：这类疾病发病的基因机制理十分复杂， 涉及一个以上的等位基因以及基因与环境因素的 相互作用，又称为多因子疾病。
3、获得性基因病：这类疾病由病原微生物感染引起， 不符合孟德尔遗传规律。
➢ 蛋白质组(proteome):指一个细胞内的全套蛋白质，反 映了特殊阶段、环境、状态下细胞或组织在翻译水平 的蛋白质表达谱。
4、基因产物的结构与功能预测
5、人类基因组omparative Genomics)
比较基因组学涉及比较不பைடு நூலகம்物种的整个基 因组，以便深入理解每个(Genomics and Medicine)
➢筛选疾病相关基因 ➢基因检测 ➢药物设计 ➢基因治疗 牛牛文档分享 牛牛文档分享
第二节 功能基因组学 （Functional Genomics）
➢鉴定（注释）基因 ➢分析基因功能 ➢鉴定基因变异 ➢描述基因表达模式 ➢生物信息学
一、概念及特点
1. 概念：利用结构基因组学提供的信息，以高通量， 大规模实验方法及统计与计算机分析为特征，全面 系统地分析全部基因及其编码蛋白的功能。包括： 生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。
❖比较基因组学（comparative genomics）：比 较不同生物间基因和基因组结构的差异，以增进 对基因功能
❖生物信息学（bioinformatics）
用数理和信息科学的观点、理论和方法研究生命现 象，组织和分析现今呈指数增长的生物学数据的一 门科学。该技术主要由数据库、计算机网络和应用 软件组成。