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第三章 基因载体的选择与构建.

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1.质粒的改造、构建与使用
删除非必需区,减小质粒的分子量,提高外源DNA 的装载量(一般来说,大于20kb的质粒很难导入受 体细胞)
加入遗传标记基因 在标记基因内引入具有多种限制酶识别及切割位点
的DNA序列,即多克隆位点(multiple cloning sites, MCS) 根据不同要求,插入特殊的基因表达调控序列
第三阶段:进一步完善载体的功能以满足基 因工程克隆中的不同要求
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(二)、载体的结构特点
至少有一个复制起点,至少可在一种生物体中有效 复制,稳定遗传
至少有一个限制酶识别位点,供外源DNA插入 至少有一个遗传标记基因,以指示载体或重组DNA
分子是否进入宿主细胞 具有较小的分子量和较高的拷贝数 具有对受体细胞的可转移性, 提高载体导入受体细胞
有一个或几个质粒拷贝; (2)松弛型控制(relaxed control):
可自主复制,因此每个宿主细胞10~200个质粒拷 贝,此对分子克隆有利。
在宿主停止合成蛋白质时宿主染色体和严紧型质 粒都不复制,而松弛型质粒可继续复制。
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(二)重要的大肠杆菌质粒载体
pSC101 Col E1质粒载体 pBR322 pUC质粒载体 pGEM-3Z质粒 穿梭质粒载体
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理想的质粒载体,应具备以下几个条件:
(1) 能自主复制,即本身是复制子 (2) 具有一种或多种限制酶的单一切割位点,并在此
位点中插入外源基因片段,不影响本身的复制功能; (3) 在基因组中有1-2个筛选标记,为寄主细胞提供
易于检测的表型特征。 (4) 分子量要小,多拷贝,易于操作。
5、把pBR313的PstI位点除去,得到pBR318。 除去EcoR II,得到pBR320。pBR322基础上衍生出来的一系列质粒载体 pUC质粒载体的优点: ◇具有更小的分子量和更高的拷贝数
(2.7kb, 500~700 copies/cell) ◇适用于组织化学法检测重组体,一步实现对阳
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pGEM-T 多克隆位点的序列
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穿梭质粒载体
人工构建的具有两 种不同复制起点和 选择标记,可以在 两种不同的寄主细 胞中存活和复制的 质粒载体。
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4.大肠杆菌中的表达载体
表达载体应含有:
(1)强启动子 (2)在启动子下游区和ATG上游区有一个好的SD序 列。 (3)在外源基因插入序列下游区要有一个强的转录 终止序列,保证外源基因有效转录和质粒的稳定性。
《基因工程原理》
第三章 基因载体(Vectors)的选 择与构建
山东理工大学生命科学学院
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第三章 基因载体的选择与构建
一 载体的一般特性 二 质粒载体 三 λ噬菌体载体 四 cos质粒(cosmid) 五 人造染色体载体(酵母人工染色体,细菌人工染
色体载体和噬菌体人工染色体载体)
7种内切酶的单一切点。 Hin d III、Bam H I和Sal I
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pSC101
EcoRI
pR6-5
大肠杆菌
Boyer 和Cohen的实验
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Col E1质粒载体
松弛型,多拷贝 1000~3000 copy 选择标记
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pBR322
特点: 多种抗药标记 分子量低:4363bp 高拷贝 多单酶切位点 不影响复制
四环素抗性基因编码一种399 AAs蛋白质, 与细菌细胞膜结合,阻止四环素分子进入细 菌细胞。
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氨苄青霉素抗性基因(Ampr)
杀菌剂,Ampicillin可抑制细菌细胞膜 上参与细胞壁合成酶类的活性,干扰细胞分 裂,杀死细胞。
Ampr抗性基因编码一种分泌到细菌细胞 周间质的酶,催化β-内酰胺环的水解,使氨 苄青霉素失活。
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葡萄糖苷酸酶基因(GUS gene)
β-葡萄糖苷酸酶可将X-Gluc(5-溴-4氯-3-吲哚 -β-D-半乳糖苷)降解为兰色产物
适用范围十分广泛,因为许多生物中没有这 种基因
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Eucalyptus occidentalis (桉树)
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荧光素酶基因(luciferase Gene)
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(四)、遗传标记基因
1.标记基因的作用:
指示外源DNA分子(载体或重组分子)是 否进入宿主细胞
指示外源DNA分子是否插入载体分子形成 了重组子
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2.标记基因的种类: 抗性标记基因 营养标记基因 生化标记基因
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3.常用的遗传标记基因
四环素抗性基因(Tetr)
抑菌剂,Tetracycline可结合在核糖体30s 亚基中的一种蛋白质分子上,抑制核糖体的 转位过程。抑制细胞蛋白质合成,细胞停止 生长。
杀菌剂,Kanamycin,Neomycin和G418均属脱 氧链霉胺氨基葡萄糖苷类抗生素,可结合在核糖 体上,导致mRNA发生错读。
来自转座子Tn5和Tn903的Kanr抗性基因均可使 这类抗生素磷酸化,使之不能进入细胞内。
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β-半乳糖苷酶基因(lacZ 和lacZα)
◇ β-半乳糖苷酶基因编码1021个氨基酸 ◇ 其氨基末端称为α链,羧基末端称为β链 ◇ α链负责将β链装配为四聚体 ◇ 单独的β链不具酶活性,只有在α链的帮助下组装成
β4才具有酶活性——α-互补作用 ◇ 为α链编码的基因称之为lacZα(编码145 AAs)
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β-半乳糖苷酶基因的优点
◇酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观
5-bromo-4-chloro-3-indolyl- β-D-galactoside
◇LacZα和β链基因的分别表达
通常以 LacZα作为载体的遗传标记基因,而由宿主 细胞表达β链
原核载体:质粒(pBR322,pUC…) 噬菌体(λ,M13)等。
真核载体:动物病毒载体pLXSN等 BAC、YAC、PAC等。
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(一)、发展概况
第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质 粒的利用,如pSC101, ColE1, pCR, pBR313
第二阶段:增大载体容量,建立多克隆位点 区和新的遗传标记基因
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2.质粒的命名
(1) 人工组建的质粒
人工组建的质粒的第一个字母是质粒英文名字(plasmid) 的第一个字符p,用小写。p后有2个字母是大写,表示质粒的 作者和实验室名称,再其后为质粒的编号。
例:pXYp109;pSC101等
(2) 天然载体质粒
天然载体质粒的第一个字母大写,且质粒符号用括号括起 来。如(C01E1)。
和SP6启动子,它们为RNA聚合酶的附着作用提 供了特异性的识别位点。由于这两个启动子分别 位于lacZ'基因中多克隆位点区的两侧(图)
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pGEM-T
pGEM用途多, 能在离体情况下合
成RNA、ssDNA。 含SP6和T7RNA聚
合酶的启动子,位 于β-半乳糖苷酶的 α-肽段的两测。
性克隆的鉴定 ◇具有多克隆位点区(MCS)
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pUC质粒载体
pBR322的复制起点 ampr,但不含酶切
位点 lacZ的启动子和编
码α-肽链的序列。 多克隆位点(MCS)
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pGEM系列载体 pGEM系列载体是一种与pUC系列十分类似的小
分子的质粒载体。 它具有两个来自噬菌体的启动子,即T7启动子
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(一)质粒一般特性
1. 质粒形状 质粒:环状质粒、线性质粒
DNA质粒、RNA质粒 Common plasmid vectors can carry up to 15kb
foreign DNA
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2.野生型质粒具有下列基本特性:
自主复制: 质粒DNA含有自己的复制起点(ori)以 及控制复制频率的基因,能够摆脱宿主染色体 DNA复制调控系统而进行自主复制,并在宿主细 胞产生不同的拷贝数
噬菌斑,即感染的细菌细胞被噬菌体裂解之 后留下的空斑。
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Life cycle:
◇ lytic cycle(裂解周期) ◇ lysogenic cycle(溶源周期)
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噬菌体
有的噬菌体(phage)基因组较大,如λ噬菌和T噬菌 体等;有的则较小,如M13、f1、fd噬菌体等。用 感染大肠杆菌的λ噬菌体改造成的载体应用最为广泛。
农杆菌质粒用p加Ti(Tumer inducing)或At (Agrobacterium tumefacions)表示,如pTiC58。
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3. 常用的质粒载体
pSC101(plasmid Stanley Cohen ) 严紧型、低拷贝,平均每
个细胞1~2个copy。 9.09kb 含有抗四环素基因(tetr)和
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pBR322: 它由三部分组成: 来自pSCl01的四环素抗
性基因Tetr 来自ColEl的衍生物
pMBl的松弛复制起点 ori 来自RSF2124的氨苄青 霉素抗性基因Ampr
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pBR322质粒载体的构建过程:
1、以pMB1为基础,引入Rldrd19质粒的Tn3易 位子。得到pMB3;
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三、 噬菌体载体
(一) 噬菌体的生物学特性 噬菌体英文名叫做
Bacteriophage(简称 phage)。 它的DNA分子除了复制起 点之外,还有编码外壳蛋 白质的基因。
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噬菌体最常见的是双链线性DNA。除此之外, 还发现有双链环形DNA、单链环形DNA、单 链线性DNA以及单链RNA等多种形式的噬菌 体。 有些噬菌体的DNA碱基并不是由标准的 A、T、G、C四种碱基组成。
2、pMB3通过EcoRI去掉无用片段,形成pMB8 质粒(2.6kb);
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