迭代法中基本操作的并行算法
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国防科学技术大学并行与分布处理重点实验室
一般稀疏矩阵与稠密向量的并行乘法(续)
例如,对非零元结构对应于下图的稀疏矩阵,在 两个进程上并行计算时,红线对应的分布更好
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将一次迭代内所有操作一起并行计算时的考虑
在内积并行计算时,为平衡负载,最好将 向量分量个数平均分布到各个进程,而向 量分量的分布与矩阵的行分布相对应,这 对应于对图进行分割时,使得各子图中的 结点数相等 在稀疏矩阵与向量并行乘时,为平衡负载, 应使得各子图内所有顶点的出边总数大致 相当 这两个目标有时是相互冲突的
使负载更平衡的一种分布形式
20分布处理重点实验室
一般稀疏矩阵与稠密向量的并行乘法
一般稀疏矩阵的非零元结构对应于一个有 向图,矩阵与向量进行乘法时,yk的计算所 依赖的x分量对应于图中结点k的出边 对应于yk的计算量完全由k的出边数量决定
在计算y=Ax时,寻找使负载平衡且通信量 最少的矩阵行分布就等价于对图G进行分割, 使各子图内所有顶点的出边总数大致相当, 而所有子图间的边数之和最少
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x ( x1 , x2 , xn ),y ( y1 , y2 , yn ),
则有 ( x, y) x1 y1 x2 y2 xn yn . 例子:
P0 x0~99 y0~99 P1 x100~199 y100~199 P2 x200~299 y200~299 P3 x300~399 y300~399
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非零元结构对应于网格的矩阵与向量相乘
简单的一维分布
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非零元结构对应于网格的矩阵与向量相乘(续)
二维分布
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国防科学技术大学并行与分布处理重点实验室
非零元结构对应于网格的矩阵与向量相乘(续)
国防科学技术大学并行与分布处理重点实验室
迭代法中基本操作的并行算法
内积的并行计算
非零元结构对应于网格的矩阵与向量相乘 一般稀疏矩阵与稠密向量的并行乘法 将一次迭代内所有操作一起并行计算时的 考虑
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国防科学技术大学并行与分布处理重点实验室
内积的并行计算
假设要计算(x,y),其中