(2) TFIIIC
(3) TFIIIB： TBP + BRF + B//
4、5s rRNA 基因转录的起始
boxA boxC
TF III A
(B’’, TBP, BRF)
TF III C
TF III B
Pol III
四、RNA 聚合酶 II 基因的转录
（一）RNA聚合酶 II 的启动子 1、组成：
1、转录起始
（1） TFIID: TBP（TATA盒结合蛋白） + TAFs（TBP协同 因子 ）
TBP
-40 -30
TATA
-20 -10 +10 +20
TAFs
TBP的作用----定位因子 a、在TATA框处与DNA
结合
b、是所有三种RNA聚
合酶转录起始所需的
因子
TBP的作用机制： a 、两个结构域形成一个完全二元对称的马鞍型 结构，与DNA小沟有效结合
3、上游启动子（upstream promoter element，UPE） （1）位置： CAAT盒 ：-70 ~ -80区（ -70区） GC盒：-80 ~ -110区（-90区）
（2）功能： 控制转录起始的频率
（基本不参与起始位点的精确定位） （3）功能特点：正反方向排列均能发挥作用
（4）上游元件的多样性
Pol III TF III B (B’’, TBP, BRF)
2、上游因子(Upstream factor)
（1）识别并与启动子上游元件结合 （2）与上游元件结合可增加转录起始的效率
上游元件 UBF1 Startpoint
（五）启动子
RNA 聚合酶Ⅰ的启动子：位于转录起点上游
RNA 聚合酶Ⅱ的启动子：位于转录起点上游
对鹅膏蕈碱的反应
不敏感
hnRNA
高度敏感
tRNA,5srRNA,snRNA 不同物种敏感性不同
（三）真核生物RNA 聚合酶（RNA Pol II）
由8~14个亚基组成，分子质量为500KDa
250KDa
与模板结合；与转录起始、延伸有关 与DNA、底物和新生的RNA结合
130KDa
40KDa
1、试述TBP对真核基因转录的作用 2、RNA聚合酶II的启动子有哪些基本元 件，各 元件的作用是什么 3、试述RNA聚合酶II羧基末端结构域（CTD）的 结构特点及对基因转录的作用
是保证RNA pol 准确结合到起始位点的一个
关键因子 b、其他的三个亚基TAF：（TBP 相关因子） 为RNApol I转录所需的亚基称为TAFI （2）功能：是使RNA 聚合酶正确的定位在起始 位点。
RNA 聚合酶 I 基因转录起始
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG
startpoint
3、tRNA基因转录的起始
boxA boxB
TF III C
TF III B
Pol III
（二）5S rRNA 基因的转录
1、 5S rRNA 基因：
特点：串连排列，形成基因簇
（是唯一单独被转录的rRNA亚基）
2、启动子： C框 ；A框
3、转录因子：
(1) TFIIIA ：结合位点为C box 。
# 同一组件可被不同因子识别/结合 CAAT CP1(-globin), CP2(-fibrinogen), CP3 Octamer Oct-1, Oct-2(immunoglobulin in Lymphoid)
（二）RNA聚合酶Ⅱ 羧基末端结构域(CTD)：
1、位置：RNA聚合酶Ⅱ最大亚基羧基末端
合物结合，N-端与TFⅡF协同作用募集RNA聚合酶II
TFIIB与TFIID结合，并为RNA聚合酶结合起一个桥梁
作用。
TF II B
（4）与RNA聚合酶与TFIIF相连的复合体结合
TF II F
Pol II
TF II F 结合Pol II并带向启动子； 两个亚基： RAP74（ATP依赖性解旋酶），可能参与DNA 双链的溶解 RAP30（与细菌因子有同源性），与RNA 聚合酶Ⅱ紧密 结合
B框(5’-GGTTCGANNCC-3’)
（2）A框和B框编码的序列： A框----D-loop； B框---- TψC-loop
2、tRNA基因转录因子
（1）TFⅢC：识别boxB
（2）TFⅢB：与A框上游50kb上游序列结合
a、组成: TBP、BRF、B” b、功能：是RNA聚合酶Ⅲ真正的起始因子
40KDa
负责酶的装配
附：真核基因在转录时RNA聚合酶需要多种
转录因子的协助
TBP
Pol I
TAFIs
（四）转录因子
1、通用因子(General factor) （1）是所有启动子起始RNA合成所必须 （2）与RNA 聚合酶在起始位点周围形成复合体， 并决定起始的位置。
TBP
Pol I
TAFIs
位于-180 ~ -107，可增加转录起始的效率。
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG
startpoint
上游控制元件（UCE）
-170 -110
核心启动子（core element）
-40 +20
人类RNA Pol I的启动子
（三）RNA Pol I的辅助因子(UBF1 & SL1)
b、TBP 与DNA 结合，使DNA 弯曲了约80°，
TATA 盒向大沟弯曲，拓宽了小沟。
（2） TFIIA
含有至少3个亚基 与TFIID结合，稳定TFIID-DNA复合体；可能通过解除
TAFs的抑制而激活TBP
TF II A
（3） TFIIB
覆盖靠近起始点的启动位置，C端与TFIID和DNA的复
RNA聚合酶II自身不能起始转录，需要依靠
转录因子的协助。
（三）RNApol II 的转录因子
TF II D TBP（TATA盒结合蛋白） + TAFs（TBP协同因子 ）
—— 结合在DNA小沟（其他DNA结合蛋白为大沟），识
别和结合核心启动子(TATA盒和Inr) TF II A —— 含数个亚基，可能通过解除TAFs的抑制而激活TBP TF II B —— 覆盖靠近起始点的启动位置，C端与TFIID和DNA 的复合物结合，N-端与TFⅡF协同作用募集RNA聚 合酶II。
2、结构特点：
（1）具有7个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser -Pro-Ser)
的重复序列（酵母：重复26次；哺乳类：52次）
（2）多个磷酸化位点：Ser、Thr
3、作用：
CTD磷酸化对调控基因转录有重要作用： （1）CTD去磷酸化，RNA聚合酶II易与DNA 结合，这种构象适于转录的起始； （2）CTD磷酸化可使RNA聚合酶II与DNA的 结合变得松弛，形成适于延伸的构象
SV40 early 胸苷激酶 Thymidine kinase
Histone H2B
-140 -120 -100 -80 -60 -40 -20
Octamer
CAAT
游元件的多样性
真核RNA 聚合酶II 启动子包含着TATA
盒、CAAT 盒、GC 盒以及其他序列元件
Pol II 离开启动子区，
进入延伸阶段
RNA聚合酶Ⅱ起始复合物的组装 启动子TATA盒+ TFⅡD + TFⅡA + TFⅡB +(RNA聚合酶+ TFⅡF)复合物 +TFⅡE 、TFⅡJ +TFⅡH（解旋酶、蛋白激酶）
DNA解旋、RNA聚合酶Ⅱ的 CTD磷酸化
polⅡ从转录因子中释放出来 从起始点向下游移动
上游控制元件（UCE）
-170 -110
核心启动子（core element）
-40
+1
+20
UBF1
TBP SL1
UBF1
TAFIs
TBP
Pol I
TAFIs
三、RNA 聚合酶III 基因的转录
（一）tRNA基因的转录 1、启动子----基因内启动子
（1）启动子的两个保守序列：
A框（5’-TGGCNNAGTGG-3’)；
TF II F ——结合Pol II并带向启动子；RAP74（ATP依赖性解 旋酶），RAP30（与细菌因子有同源性） TF II E —— 扩大DNA覆盖区至+30 TF II H 和TF II J —— H有激酶活性， 使Pol II 的CTD 磷酸化 ，PolⅡ 离开启动子区
（四）RNA PolⅡ基因转录的过程
RNA 聚合酶III的启动子：位于转录起点下游
基因内启动子
二、RNA 聚合酶 I 基因的转录
（一）rRNA基因（Ribosomal RNA Genes ）
多拷贝基因
（二）RNA聚合酶Ⅰ启动子
1、核心启动子（core promoter）或核心元件： 位于-45 ~ +20，负责转录的起始。
2、上游控制元件（upstream control element ）：
（5）TF II E 扩大DNA覆盖区至+30
TF II E
（6）TF II H 和TF II J加入复合物
（7）TF II H 有多种酶活性，包括ATP酶、解旋酶、和可使Pol II 的 CTD 磷酸化的激酶活性。
Pol II 的CTD 磷酸化 ，
TF II 在PolⅡ离开启动 子前释放，形成适于 延伸的构象
（3）多聚A尾的添加 a、RNA聚合酶Ⅱ并不在AAUAAA 序列或poly （A）添加位点终止，而往往继续转录，因此
大部 分已知基因的初级转录产物拥有poly（A）
添加位点下游0.5~2kb核苷酸序列