一、重要名词类(部分):●DNA半保留复制(简称复制)(semiconservative replication):DNA复制时,亲代DNA双螺旋结构解开,分别以解开的两股单链为模板,以dNTP为原料,按照碱基互补的原则,合成与模板链互补的新链,从而形成两个子代DNA双链,其结构与亲代DNA双链完全一致.因子代DNA双链中的一股单链源自亲代,另一股单链为合成的新链,形成的双链与亲代双链的碱基序列完全一致,故称为半保留复制。
●复制叉:原核生物DNA的复制从单一起点开始,双螺旋结构被打开,分开的两股单链分别作为新DNA 合成的模板,DNA合成从起点开始向两个方向进行,与单一起点相连的局部结构形状呈“Y”型,称复制叉结构.●复制子:基因组中能独立进行复制的DNA单位称为复制子或复制单位。
它含有控制复制起始或终止的特定位点,从复制起始点到终止点的区域为一个复制子.●半不连续复制:复制过程中,催化DNA 合成的DNA聚合酶只能催化核苷酸从5’→3'方向合成,以3'→ 5'链为模板时,新生的DNA以5'→3’方向连续合成;而以5’→3’为模板只能合成若干反向互补的岡崎片段,这些片段再相连成完整的新链,故称半不连续复制。
(前导链、滞后链)●冈崎片段:DNA双链是反向平行的,复制时,亲代双链DNA在复制叉处打开,由于新链的合成具有方向性,即从5’→3’,以5'→3’DNA链为模板合成反向互补的新链时,只能合成小片段DNA,这些片段根据发现者命名为岡崎片断.●转录:是指以DNA为模板,合成RNA的信息传递过程。
除了某些RNA病毒的基因组之外,所有的RNA 都是转录产物。
●反义链:在基因的DNA双链中,转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链.●上游顺式作用元件:在真核基因中存在着很多的位于转录起始点上游的顺式调控序列,这些DNA序列称之为上游顺式作用元件.是指与结构基因表达调控相关、能够被调控蛋白特异性识别和结合的DNA 序列,包括启动子、上游启动子元件等,它们是通过与反式作用因子的相互作用来调节基因转录活性。
●启动子:是基因DNA中一段特定的核苷酸序列,是与启动机因表达相关的顺式作用元件,式RNA聚合酶在转录起始时对模板DNA的识别位点和结合位点,是基因转录的开始部位,也即是转录是否能起始的决定位点.●终止子:促进转录终止的DNA序列,在RNA水平上通过转录出的终止子序列形成茎-环结构而起作用。
又可分为依赖于ρ因子的终止子和不依赖于ρ因子的终止子两类。
●转录后加工:在转录中新合成的RNA往往是较大的前体分子,需要经过进一步的加工修饰,才转变为具有生物学活性的、成熟的RNA分子,这一过程称为转录后加工。
●多顺反子:在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA连在一起,相互之问由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种mRNA叫做多顺反子mRNA.●RNA编辑:某些mRNA的核苷酸序列,在生成转录产物后还需插入、删除或取代一些核苷酸残基,方能生成具有正确翻译功能的模板,遗传信息在mRNA水平上的改变过程,称为RNA编辑。
●PCR:即聚合酶链式反应,扩增样品中的DNA量和富集众多DNA分子中的一个特定的DNA序列的一种技术.在该反应中,使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮DNA合成。
其中包括DNA 变性、引物退火和在TaqDNA聚合酶催化下的DNA合成。
●基因:能够表达和产生蛋白质和RNA的DNA序列,是决定遗传性状的功能单位.●结构基因:指一类编码细胞结构和基本代谢活动所必要的RNA、蛋白质或酶。
一般来说,它们不是调控因子。
●调控基因:是指那些编码那些控制其他基因表达的RNA或蛋白质的基因.调控基因的表达产物是调控因子。
调控基因也是结构基因,只是它的编码蛋白质具有基因调控的功能,是在基因水平上而不是蛋白质水平上的控制.●基因组:细胞或生物体的一套完整单倍体的遗传物质的总和。
●翻译(translation):以mRNA为模板,氨酰-tRNA为原料直接供体,在多种蛋白质因子和酶的参与下,在核糖体上将mRNA分子上的核苷酸顺序表达为有特定氨基酸顺序的蛋白质的过程。
●端粒:以线性染色体形式存在的真核基因组DNA末端都有一种特殊的结构叫端粒.该结构是一段DNA 序列和蛋白质形成的一种复合体,仅在真核细胞染色体末端存在.●操纵子:是指数个功能上相关的结构基因串联在一起,构成信息区,连同其上游的调控区(包括启动子和操纵基因)以及下游的转录终止信号所构成的基因表达单位,所转录的RNA为多顺反子。
●顺式作用元件:是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列。
包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等。
●反式作用因子:是指真核细胞内含有的大量可以通过直接或间接结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子.●增强子:位于真核基因中远离转录起始点,能明显增强启动子转录效率的特殊DNA序列.它可位于被增强的转录基因的上游或下游,也可相距靶基因较远。
●基因表达:是指生物基因组中结构基因所携带的遗传信息经过转录、翻译等一系列过程,合成特定的蛋白质,进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应的全过程。
●分子克隆:在体外对DNA分子按照即定目的和方案进行人工重组,将重组分子导入合适宿主,使其在宿主中扩增和繁殖,以获得该DNA分子的大量拷贝。
●DNA变性:在物理或化学因素的作用下,导致两条DNA链之间的氢键断裂,而核酸分子中的所有共价键则不受影响。
●DNA复性:当促使变性的因素解除后,两条DNA链又可以通过碱基互补配对结合形成DNA双螺旋结构●突变(mutation):基因组DNA顺序上的任何一种改变都叫做突变。
分点突变和结构畸变。
●点突变(Point mutation)是指一个或几个碱基对被置换(replacement),这种置换又分两种形式:转换(transition)一--指用一个嘌呤碱置换另一个嘌呤碱,一个嘧啶碱置换另一个嘧啶碱;颠换(transversion)一—-指用嘌呤碱置换嘧啶碱或用嘧啶碱置换嘌呤碱。
●错义突变:DNA分子中碱基对的取代,使得mRNA的某一密码子发生变化,由它所编码的氨基酸就变成另一种的氨基酸,使得多肽链中的氨基酸顺序也相应的发生改变的突变。
●无义突变:由于碱基对的取代,使原来可以翻译某种氨基酸的密码子变成了终止密码子的突变。
●同义突变:碱基对的取代并不都是引起错义突变和翻译终止,有时虽然有碱基被取代,但在蛋白质水平上没有引起变化,氨基酸没有被取代,这是因为突变后的密码子和原来的密码子代表同一个氨基酸的突变。
.●同义密码子(synonym codon):为同—种氨基酸编码的各个密码子,称为同义密码了。
●移码突变:在编码序列中,单个碱基、数个碱基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突变位点之后的三联体密码阅读框发生改变,不能编码原来的蛋白质的突变.●管家基因:在生物体生命的全过程都是必须的,且在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因。
●SD序列:转录出的mRNA要进入核糖体上进行翻译,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列与大肠杆菌16S rRNA3,末端富含嘧啶的序列互补,是核糖体的识别位点。
●CAP:是大肠杆菌分解代谢物基因活化蛋白,这种蛋白可将葡萄糖饥饿信号传递个许多操纵子,使细菌在缺乏葡萄糖时可以利用其他碳源。
●回文序列:DNA片段上的一段所具有的反向互补序列,常是限制性酶切位点。
●蓝-白斑筛选:含LacZ基因(编码β半乳糖苷酶)该酶能分解生色底物X—gal(5-溴—4—氯—3—吲哚-β-D—半乳糖苷)产生蓝色,从而使菌株变蓝。
当外源DNA插入后,LacZ基因不能表达,菌株呈白色,以此来筛选重组细菌。
称之为蓝-白斑筛选。
●DNA聚合酶(DNA polymerase):指以脱氧核苷三磷酸为底物,按5’→ 3'方向合成DNA的一类酶,反应条件:4种脱氧核苷三磷酸、Mg+、模板、引物。
DNA聚合酶是多功能酶,除具有聚合作用外,还具有其它功能,不同DNA聚合酶所具有的功能不同。
●拓扑异构酶(topoisomerase):是一类引起DNA拓扑异构反应的酶,分为两类:类型I的酶能使DNA 的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量,类型Ⅱ的酶能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入超螺旋时,需要由ATP供给能量。
●单链DNA结合蛋白(single-strand binding protein ,SSB):是一类特异性和单链区DNA结合的蛋白质。
它的功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶降解。
●修复(repair):除去DNA上的损伤,恢复DNA的正常结构和功能是生物机体的一种保护功能。
●光裂合酶修复(又称光复活)(photoreactivation):可见光将光裂合酶激活,它分解DNA上由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体,使它们恢复成两个单独的嘧啶碱。
●切除修复(excision repair):在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤部分切除,以互补链为模板,合成出空缺的部分,使DNA恢复正常结构的过程。
●重组修复(recombination repair):DNA在有损伤的情况下也可以复制,复制时子代链跃过损伤部位并留下缺口,通过分子间重组,从完整的另一条母链上将相应的核苷酸序列片段移至子链缺口处,然后用再合成的多核苷酸的序列补上母链的空缺,此过程称重组修复。
●诱导修复和应急反应(induction repair and SOS response)(SOS修复):由于DNA受到损伤或复制系统受到抑制所诱导引起的一系列复杂的应急效应,称为应急反应。
SOS反应主要包括两个方面:DNA损伤修复(SOS修复或称诱导修复)和诱变效应。
SOS修复是一种易出差错的修复过程,虽能修复DNA的损伤而避免死亡.但却带来高的变异率.●DNA重组(recombination):DNA重组是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中、病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。
●基因工程(又称基因重组技术)(gene/genetic engineering):是将外源基因经过剪切加工,再插入到一个具有自我复制能力的载体DNA中,将新组合的DNA转移到一个寄主细胞中,外源基因就可以随着寄主细胞的分裂进行繁殖,寄主细胞也借此获得外源基因所携带的新特性。
●转录(transcription):由依赖于DNA的RNA聚合酶催化,以DNA的一条链的一定区段为模板,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链互补的RNA链的过程。
●模板链(template strand)[又称负(-)链,反意义链(antisense strand)]:转录过程中用作模板的这条DNA链,称模板链。