蛋白表达解决方案
Film
Concentration
Concentration
与传统的压片法对比ChemStudio系列成像系统在相同曝光时间内能得 到更宽的定量范围和更高的灵敏度
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化学发光成像的局限
分子量大小非常接近的蛋白(磷酸化蛋白)
特点:分子量非常接近,无法进行剪膜检测 传统操作方法: 先检测第一个蛋白 将第一个目标蛋白的抗体剥离掉(巯基乙醇处理5-6个小时,且会 将第二个目标蛋白洗掉一部分,影响检测结果的准确性) 检测第二个蛋白 方法缺陷:检测步骤繁琐、巯基乙醇气味难以忍受、检测结果不准确
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Western 检测的方法
化学发光
压片法
灵敏度高,定量范围窄 灵敏度高,定量范围宽 定量准确、多重检测 背景高 背景低、定量准确 定量范围窄,灵敏度低
CCD成像
多色荧光
RGB荧光 NIR荧光
DAB显色
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最优化方案-两种方法结合使用
化学发光(灵敏度) + 近红外多色荧光
(宽线性范围,多重检测,持久信号)
激光
固定波长 最强 满足 背景太高 不可拓展
透射荧光
支持
不支持
不支持
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滤光片的选择
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AJ如何帮助客户如何提高实验效率?
快速半干转印 快速:15min-50min,湿转一般1.5h-过夜 节省缓冲液、冷却循环水腔
高通量湿转模块
可同时转印4块凝胶 通量更高
德国耶拿公司—Western Blot 整体解决方案 样品制备 蛋白定量 聚丙烯酰胺凝胶电泳
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Western Blot Workflow-Detection
DAB显色
生成有色物质 沉淀在膜上
被检测
DAB显色法检测灵敏度低,不能有效的检测低丰度蛋白,且定量范围只有1.5OD
更灵敏的检测方法:化学发光法
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化学发光检测的优势
• 定量范围更广 • 高灵敏度(化学发光一般光强很弱)
检测方法:
8
UVP Chemstudio系列超敏化学发光成像
可用于极地丰度蛋白表达的检测
-60度科研冷CCD
4/3英寸超大芯片
Bining功能
高光通透性镜头
宽泛的动态范围
专用化学发光托盘
810万
物理像素
极高的物理像素
化学发光级暗箱
数据可追溯
VisionWorks LS 软件 图像信息可以追踪溯 源,任何修改都可以直接显示,确保分析结果 的可信度
• 底片检测(传统的压片,显影,定影) • CCD摄像头检测
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Chemiluminescence-Western Blot
传统X光压片检测
16
Chemiluminescence-Western Blot
无需外在激发光源,依靠自身发光,一般要求高灵敏度的冷CCD
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为什么 CCD技术优于底片成像?
匀浆器ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
垂直电泳、电泳电源
转膜
膜封闭,一/二抗体标记
显影检测
湿法或半干转印 、电源
小型摇床
成像系统
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Thanks for your Attention
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蛋白表达整体解决方案
Quality is the Difference!
主要内容 1,成功案例分享 2,蛋白表达客户工作流程及存在的问题 3,AJ 解决方案
德国耶拿公司—Western Blot 整体解决方案 样品制备 蛋白定量 聚丙烯酰胺凝胶电泳
匀浆器
垂直电泳、电泳电源
转膜
膜封闭,一/二抗体标记
显影检测
湿法或半干转印 、电源
小型摇床
成像系统
3
Western 流程
蛋白样品的制备
•SDS-PAGE •转膜 •封闭 •一抗杂交 •二抗杂交 •成像检测
4
蛋白表达客户工作流程及存在的问题 随着科研的深入,实验越来越难做
• 高丰度的蛋白越来越少,低丰度蛋白越来也多 • 多蛋白共同作用的研究越来越多,比如蛋白磷酸化修饰 • 研究向纵深方向开展,不仅要做体外检测,还要做在体实时 检测
分析结果是否使用的是原始数据 原始数据是否被人修改
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Nature对western blotting数据的要求
电泳胶和印迹 “For quantitative comparisons, appropriate reagents, controls and imaging methods with linear signal ranges should be used.” “对于定量比较实验,应该使用适当的试剂、参比及线性 范围内的成像方法。” --- Nature
底片的动力学线性范围低(1.5 ~ 1.9 个数量级) CCD可进行更精确的浓度比较 CCD无需多次曝光
CCD系统 可提示过饱和反应
过饱和像素警示 底片无法警示过饱和区域------数据失真
CCD 系统无需任何消耗品
无需底片及冲洗试剂 无需冲洗设备及暗室
降低了输出成本 (热敏打印 vs. 底片)
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化学发光 vs. X光片曝光
X光片曝光 所需材料 线性范围 灵敏度
化学发光
胶片、暗室、显影液、 只需一台成像仪 定影液…… 窄,只有约1.8 O.D. 最灵敏的检测方法 低至fg级 宽,超过4 O.D. 最灵敏的检测方法 低至fg级
21
CCD成像与胶片法对比
Film
CCD
Intensity Intensity
5
蛋白表达客户工作流程及存在的问题
• 蛋白表达的结果与基因表达不匹配 • 不同的学生做出来的结果不一样,结果随机性大,不好重复 • 审稿人对蛋白表达结果有异议,不知道该如何提供证据
6
蛋白表达客户工作流程及存在的问题
• 耗时长,工作效率低
7
原因
仪器灵敏度不够
没有选择正确的western 检测方法 没有按照正确的操作进行试验 没有使用最有效的转印方法
CCD与光学强度具有真正的线性对应关系 底片的反应是非线性的
CCD
CCD Counts
底片
pg. SA-HRP
Densitometric Counts (OD)
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定量线性范围比较
成像方式 CCD 成像
15s 曝光
3D显示
Film
19
为什么 CCD技术优于底片成像?
CCD具有更宽的动力学线性范围(>4.0 个数量级)
近红外成像更适合western blot成像
NIR
NC膜、PVDF膜在不同激发波长 下的荧光背景 NIR波长下膜的背景极低, 更适合做western blot检测
近红外成像
RGB可见荧光成像
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近红外荧光相对于RGB荧光背景低,结果灵敏度 更高,准确性更高,图片更漂亮,因此被广泛应用于 western blot 多色荧光成像
表达变化差异>104
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荧光标记抗体的使用
荧光素
化学发光,二抗由酶标记
荧光,二抗由荧光素标记
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多色荧光—多重检测
Goat antirabbit
Goat antimouse
Rabbit anti-COX IV
Mouse anti-tubulin
COX IV
AlphaTubulin
COX IV
如何选择合适的western blot检测方法?
Western Blotting数据的可信度问题
Source: “All Data are not created Equal” Editorial by Ushma S. Neill, The Journal of Clinical Investigation Volume 119:424, 2009
斯隆-凯瑟琳癌症中心主任Ushma S. Neill在担任 “临床调查研究杂 志”评审期间曾连续拒绝了四篇本已接受并准备发表的来稿后明 确指出,所有提交的western数据的建立必须是平等的,其中包括:
1. 2. 所采用的检测方法定量范围是否可靠? 实验者如何确定化学发光的曝光时间?
3.
4. 5.
是否有内参?内参是否可靠?
Alpha-Tubulin
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分子量接近的多蛋白检测对比
凝胶制备
化学发光法
多色荧光法
电泳
电泳
抗体杂交
需要将第一个目的蛋 白的抗体剥离掉,然 后再进行第二个目的 蛋白的抗体杂交检测
成像检测
~5h
目的蛋白抗体剥离 26
磷酸化蛋白检测
化学发光法 无法准确区分和定量目的蛋白
多色荧光法检测 两个目的蛋白分开检测,再后续合并成一张图片 27 不同蛋白之间无干扰 准确区分和定量目的蛋白
LED光源:
波长固定不可改变,光强弱,无法进行小动物成像,无法提供透射光源
激光光源:
波长固定不可改变,光强太强,易造成荧光淬灭,背景高,无法同时提供 顶置和透射光源
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荧光光源介绍 氙灯/卤素灯
光谱范围 光强 Western成像 小动物成像 应用拓展 全光谱 强 满足 最优 灵活拓展
LED
固定波长 弱 满足 不支持 不可拓展
最优搭配
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UVP Chemstudio全能成像
超敏化学发光 多色荧光 近红外多色荧光
在体实时检测的解决办法—活体成像
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在体实时检测
动物成像
植物成像
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荧光光源介绍
氙灯光源:
可以为成像系统提供从紫外到近红外的全光谱激发光, 即可作为顶置光源,亦可作为透射光源,无限扩展了仪 器的荧光成像应用。 氙灯光源提供更强的激发光,提高检测灵敏度。 应用举例:RGB/NIR多色荧光成像、2D DIGE、小动物 活体成像和植物成像。