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分子生物学技术


为使核酸牢固结合在膜上,通常还将点样 后的膜进行80℃真空烘烤2h。 应用斑点印迹技术,可在一张膜上同时进 行多个样品的检测,操作简便、快速,在 临床诊断中应用较广。适合进行特定基因 的定性及定量研究,但不能鉴定所测基因 的分子量。(2) Southern印迹(Southern blot) 这是指将DNA片段经琼脂糖凝胶电泳分离 后转移到固相支持物上的过程。常规处理 如下,先用限制性内切酶对DNA样品进行 酶切处理,经琼脂糖凝胶电泳将
用探针对细胞或组织切片中的核酸杂交并 进行检测的方法称之为核酸原位杂交。某 特点是靶分子固定在细胞中,细胞固定在 载玻片上,以固定的细胞代替纯化的核酸, 然后将载玻片浸入溶有探针的溶液里,探 针进入组织细胞与靶分子杂交,而靶分子 仍固定在细胞内。例如。可用特异性的细 菌、病毒的核酸做为探针对组织、细胞进 行原位杂交,以确定有无该病原体的感染 等。原位杂交不需从组织中提取核酸,对 于组织中含量极低的靶序列有极高的敏感 性,在临床应用上有独特的意义。
碱基的缺失或插入尤为适用2.按标记物划 分 有放射性标记探针和非放射性标记探 针两大类。放射性标记探针用放射性同位 素做为标记物。放射性同位素是最早使用, 也是目前应用最广泛的探针标记物。常用 的同位素有32P、3H、35S。其中,以32P应用 最普遍。放射性标记的优点是灵敏度高, 可以检测到Pg级;缺点是易造成放射性污 染,同位素半衰期短、不稳定、成本高等。 因此,放射性标记的探针不能实现商品化。 目前,许多实验室都致力于发展非放射性 标记的探针。
(三)基因的结构
基因的编码区(即转录区)是连续不断的 序列,包括一个起始密码子ATG和一个终 止密码子TAA。编码区的两侧是转录而不 转译的侧翼序列区,其中5`非转译区简称 5`UTR,含有一个核糖体结合位点及一个 转录起始信号;3`非转译区简称3`UTR含有 一个转录终止信号。 无论是真核的基因还是原核的基因,都可 划分成编码区和非编码区两个基本组成部 分。 编码区含有大量的可以被细胞质中转译机 器阅读的遗传密码,包括起始密码子(通
降温复性。)核酸探针是指带有标记物的 已知序列的核酸片段,它能和与其互补的 核酸序列杂交,形成双链,所以可用于待 测核酸样品中特定基因序列的检测。每一 种病原体都具有独特的核酸片段,通过分 离和标记这些片段就可制备出探针,用于 疾病的诊断等研究。
(一) 核酸探针的种类 一 1.按来源及性质划分 可将核酸探针分为 基因组DNA探针、cDNA探针、RNA探针 和人工合成的寡核苷酸探针等几类。 作为诊断试剂,较常使用的是基因组DNA 探针和cDNA探针。其中,前者应用最为广 泛,它的制备可通过酶切或聚合酶链反应 (PCR)从基因组中获得特异的DNA后将其克 隆到质粒或噬菌体载体中,随着质粒的复 制或噬菌体的增殖而获得大量高纯度的 DNA探针。
因此,顺反子概念表明:基因不是最小单 位,它仍然是可分的;并非所有的DNA序 列都是基因,而只有其中某一特定的多核 苷酸区段才是基因的编码区。 每一个顺反子就是一段核苷酸序列,或者 是一个基因的DNA或RNA单元,它编码一 种完整的多肽链。顺反子是功能单位,它 是由许多可以突变的位点组成的,而这些 位点之间又可以发生交换。 多体蛋白质(multimeric proteins):由数 多体蛋白质 个亚基组成的蛋白质。
2. RNA探针 全基因RNA探针可用RNA病毒的基因标记 即可;由DNA转录出探针RNA,可由RNA 聚合酶获得大量高纯度的RNA,其灵敏度 比DNA探针高出10多倍。
(三) 核酸杂交 杂交技术有固相杂交和液 三 相杂交之分。固相杂交技术目前较为常用, 先将待测核酸结合到一定的固相支持物上, 再与液相中的标记探针进行杂交。固相支 持物常用硝酸纤维素膜(nitroce,简称NC膜)或尼龙膜(nylon membrane)。固相杂交包括膜上印迹杂交和 原位杂交。前者包括三个基本过程:第一, 通过印迹技术将核酸片段转移到固相支持 物上;第二,用标记探针与支持物上的核 酸片段进行杂交;第三,杂交信号的检测。
目前应用较多的非放射性标记物是生物素 (Biotin)和地高辛(digoxigenin)。二者都是半 抗原。生物素是一种小分子水溶性维生素, 对亲和素有独特的亲和力,两者能形成稳 定的复合物,通过连接在亲和素或抗生物 素蛋白上的显色物质(如酶、荧光素等)进行 检测。地高辛是一种类固醇半抗原分子, 可利用其抗体进行免疫检测,原理类似于 生物素的检测。地高辛标记核酸探针的检 测灵敏度可与放射性同位素标记的相当, 而特异性优于生物素标记,其应用日趋广 泛。
储藏在基因中的遗传信息分转录和转译两 步进行表达,这种遗传信息从DNA到RNA 再到蛋白质的流向,在所有的细胞类型中 都是受到高度调节的,同时在有些情况下 也是严格协同的。基因表达的此种严格调 控机理,保证细胞不会浪费能量用于合成 它所不需要的基因产物。 从基因研究上,操纵子概念比顺反子又进 了一步。即基因不但在结构上是可分的, 而且在功能上也是有分工的。同时,有的 基因控制蛋白质产物的合成,而有的基因 并没有直接的产物。 操纵子模型
将 RNA进行反转录,所获得的产物即为 cDNA。cDNA探针适用于RNA病毒的检测。 cDNA探针序列也可克隆到质粒或噬菌体中, 以便大量制备。将信息RNA(mRNA)标记也 可作为核酸分子杂交的探针。但由于来源 极不方便,且RNA极易被环境中大量存在 的核酸酶所降解,操作不便,因此应用较 少。用人工合成的寡聚核苷酸片段做为核 酸杂交探针应用十分广泛,可根据需要随 心所欲合成相应的序列,可合成仅有几十 个bp的探针序列,对于检测点突变和小段
(二)核酸探针的制备 1. DNA探针制备 (1)以病原细胞核或病毒中提取的特异性 DNA,用理化学方法将其纯化,然后再用 限制性核酸酶将DNA切割成若干片段,电 泳回收目的DNA; (2)酶促反应合成法,即从病原中提取 mRNA,在反转录酶作用下合成互补结构 的DNA(cDNA); (3) 化学合成法,以单核苷酸为原料, 人工合成DNA的某一片段。
溴化乙锭(EB)染色,然后分析DNA酶切 片段的数目、迁移率等分析微生物的变异 现象、鉴定毒株、分型及了解基因结构和 进行流行病学研究等等。 方法: 1.DNA抽提 2.DNA 酶切 3.电泳 4.染色 5.观察、照相 6.分析 7.酶切图谱
核酸探针技术
前言
(一) 核酸探针的种类 一 (二) 核酸探针的制备 (三) 核酸杂交 三 (四) 核酸探针技术在动物检疫中的应用 四
前言
化学及生物学意义上的探针(probe),是指 与特定的靶分子发生特异性相互作用,并 可被特殊的方法探知的分子。抗体-抗原、 生物素-抗生物素蛋白、生长因子-受体的相 互作用都可以看作是探针与靶分子的相互 作用。 核酸探针技术原理是碱基配对。互补的两 条核酸单链通过退火形成双链,这一过程 称为核酸杂交。(基本过程是:加热变性
同型多体蛋白质: 同型多体蛋白质:在多体蛋白质中,如果 所有的亚基都是同样的,这种蛋白质就属 于同型多体(homomultimer)蛋白质,由 一种基因编码。 异型多体( 异型多体(heteromultimer)蛋白质:亚 )蛋白质: 基各不相同的蛋白质,由多种基因编码。 如血红蛋白。
(二)基因的碱基顺序与蛋白质的氨 基酸顺序
常是AUG)和终止密码子(UAA,UAG或 UGA)。非编码区结构中的5`末端非转译 区(5`UTR)和3`末端非转译区(3`UTR), 对于基因遗传信息的表述是必要的,但它 们都不会被转译成多肽序列。 真核基因与原核基因的区别: 事实上,真核生物的基因都是以单顺反子 的形式存在,因此它们编码的也都是单基 因产物。而大肠杆菌类原核生物往往是多 顺反子,它转录的是一种大分子量的 mRNA,可同时编码两种甚至数种的基因 产物。
1. 中心法则(central dogma):既遗传信 息是从DNA流向RNA,再由RNA流向蛋白 质 而遗传信息从DNA直接到蛋白质的传递, 只是一种理论上的可能性,迄今尚未得到 证实。
2. 密码子:每3个碱基编码一种氨基酸,就 会编码出64种(43=64)不同的氨基酸。蛋 白质分子是由20种不同的氨基酸构成的, 因此,1种氨基酸可有几个不同的密码子, 既3个碱基甚至更多的碱基编码一种氨基酸 是必要的。 遗传密码是否重叠?研究证实:遗传密码 是不重叠的。 三联体之间是否存在着“逗号”?研究证 实:碱基的阅读是从一个固定的起点按序 进行的,不存在有什么“逗号”的问题。 …QABCQDEFQGHIQJKLQ…
近年来液相杂交技术有所发展。液相杂交 与固相杂交的主要区别是不用纯化或固定 的靶分子,探针与靶序列直接在溶液里作 用。液相杂交步骤有所简化,杂交速度有 所提高,增加了特异性和敏感性,但与临 床诊断所要求的特异性和敏感性还有一定 的距离。 各种杂交技术中,膜上印迹杂交技术应用 最为广泛,它由以下三个基本过程组成。 1.核酸印迹技术 (1) 斑点印迹(Dot-blot) 将待测核酸样品变 性后直接点样在膜上,称之为斑点印迹。
二、核酸探测技术
(一)指纹图谱 (二)核酸分子杂交
(一)、指纹图谱
指纹图谱: 指纹图谱:即核酸酶切图谱,对生物的蛋 白质、DNA和RNA进行分析的电泳图、杂 交放射性自显影图等。在微生物研究上, 主要是用限制性内切酶(ERA)对病毒、 细菌DNA进行酶切分析的图谱。 原理: 原理:在微生物(细菌)细胞中有1种限制 性内切酶类(II,称为RE),能特异性的 识别和切割DNA链上特定的一段DNA片段, 这类酶广泛应用于基因工程的各个方面。 ERA就是用RE消化病毒或细菌的DNA或质 粒,将消化物于琼脂凝胶中电泳分离,经
(四)基因的表达与调控
结构基因(structural gene):编码细胞成份, 如代谢酶类、转运蛋白质和细胞骨架成份 等的基因。 调节基因(regulatory gene):编码控制其他 基因表达的RNA或蛋白质产物的基因。 操纵基因(operator): 指接受来自调节基因 合成的调节蛋白的作用,使结构基因转录 活性得以抑制的特定的DNA区段,也称为 控制单元。
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