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分子生物学分析技术

TOPO 克隆技术 Gate-way克隆技术 TA 克隆技术,平末端克隆技术 预制克隆(基因库,基因组库) 测序技术
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5 基因导入
转化:以质粒为载体,将携带外源基因的载体 DNA导入原核细胞。 转染:将DNA,RNA,siRNA 或寡聚核苷酸导入到真核细胞中。 转导: 借助病毒将DNA转入细胞的过程。
6 Invitrogen Proprietary & Confidential
1.1.1.1 质粒的分类
克隆载体:应用于目标片断的复制和扩增
表达载体:强启动子,启动基因转录产生大量的mRNA,进行蛋白表达 具有表达必须的元件,及末端的短肽 依宿主细胞不同,分为真核表达质粒与原核表达质粒。 。
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Gene Viral System
Gene Yeast Gene Baculovirus
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Invitrogen 相关产品
反转录酶 一步RT-PCR 两步RT-PCR RACE 技术(5’ RACE, 3’ RACry) 全长cDNA克隆
分子生物学分析技术
Huang Xu Technical Support Aug, 2006
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内容提要
1核酸 1.1 DNA 的主要类型 1.1.1 质粒(plasmid DNA) 1.1.2 基因组 (genomic DNA) 2 .1 RNA 的主要类型 2.1.1 mRNA 2,2,2 其他类型的RNA 2 中心法则 2.1 转录 2.1.1 转录 2.1.2 逆转录(反转录) 2.2 翻译(表达) 2.3 蛋白质 3 PCR (多聚酶链式反应) 4 克隆 5 表达 PCR酶,PCR试剂系统 TOPO克隆技术,Gate-way,限制性内切酶 预制克隆(基因库,基因组库) DNA 转化,DNA 转染, 五大表达系统 蛋白纯化,蛋白检测,功能分析 质粒DNA提取试剂 基因组DNA提取试剂 mRNA提取试剂 其他RNA提取试剂 核酸定量,标记试剂盒 qPCR 试剂盒 核酸检测试剂盒 核酸突变试剂盒
反转录酶(一步RT-PCR,两步R技术
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1 核酸分子的组成


核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸
核苷中的戊糖羟基被磷酸酯化,就形成核苷酸
核苷酸 磷酸
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1.1.1 plasmid DNA 的概念
质粒是存在于细菌等微生物细胞染色体以外,能独立进行复制和遗传, 可赋予宿主细胞一定生物学性状的共价闭环双链DNA分子。
1. 复制子:复制起始区,控制着质粒在细菌中的拷贝数 有ColE1,pMB1,pSC101 2. 选择标记基因:ampr, tetr, kanr、 3. 多克隆位点(multiple cloning site, MCS): 4. 启动子(promoter):启动基因的转录,如Ptac, PCMV, PSV40等。来自rRNA(核糖体RNA)
tRNA(转运RNA)
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Invitrogen 核酸产品
质粒DNA提取试剂(plasmid DNA) 基因组DNA 提取试剂 (genomic DNA) RNA提取试剂 (总RNA,mRNA,miRNA) 核酸定量试剂盒 (Quant-iT) 核酸标记试剂盒 (labelling Kit) 核酸检测试剂盒 (SYBR Green 系列) 核酸突变试剂盒 (GeneTailor) qPCR 试剂盒(实时定量试剂盒)
4.1 TOPO 克隆技术
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4.2 Gateway® 克隆技术
ccdB
at tL 1 at tR 1
gene
2 tL at
2 tR at
Entry Clone
+
Destination Vector
Kmr LR Reaction LR Clonase™ Mix
脱氧 核糖
核苷由戊糖和碱基缩合而成,并以糖苷键相连接, 糖环上的C1与嘧啶碱的N1或者嘌呤碱的N9连接。
核苷
戊糖 碱基
核糖
D-核糖(RNA) D-2-脱氧核糖(DNA)
3
A G T C U
腺嘌呤 鸟嘌呤 胸腺嘧啶 胞嘧啶 尿嘧啶
DNA:A,G,C,T RNA:A,G,C,U
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转化用感受态细胞 转染用阳离子试剂 培养基 腺病毒载体,慢病毒载体,杆状病毒载体 抗生素
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6 表达
基因表达就是基因转录及翻译的过程。在一定调节机制控制下,大多数 基因经历基因激活、转录及翻译等过程,产生具有特异生物学功能的蛋 白质分子
2.3 Protein (蛋白质)
蛋白质 是由一条或是多条肽链组成的大分子,每一条多肽链都是由一系列氨基 酸残基通 过肽键一个一个连接而成 多肽链的第一个残基保留它的氨基,而最后一个残基保留它的羧基,多肽链的末端分别被 称为N端和C端
组成氨基酸的特点 是具有H2N-CHR-COOH的普遍结构的两性分子
1.1.2 genomic DNA (基因组DNA)
基因组指细胞中所有DNA的总和,一般是指组成染色体的DNA。
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1 .2 RNA
总RNA rRNA,tRNA,mRNA 的总和
mRNA(信使RNA) 信使RNA,3’带有polyA,5’带有帽子结构
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转化方法(原核细胞)
电击方法 化学方法
Primary Use: CLONING
Plasmid Bacterium
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转染方法(真核细胞)
在优化条件下将阳离子脂质体试剂加入水中时,其可以形成微小的(平均大小约100400nm)单层脂质体。这些脂质体带正电,可以靠静电作用结合到DNA的磷酸骨架上以 及带负电的细胞膜表面。形成DNA-阳离子脂质体复合物(图1)。一个约5kb的质粒会结 合2-4个脂质体。被俘获的DNA就会被导入培养的细胞。现存对DNA转导原理的证据来源 于内吞体和溶酶体。
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表达载体
强启动子 识别元件
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Gene Gene In Vitro Tags Gene Your Vector**
Gene E. coli
Gene Entry Clone
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3 PCR
The Power of PCR: Small DNA sample can amply to 2n (where n is number of cycles)
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转导方法(病毒介导)
慢病毒表达系统
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杆状病毒表达系统
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Invitrogen 产品
gene
Apr BP Reaction BP Clonase™ Mix
ccdB
at tB 1
at tP 1
2 tP at
Expression Clone
2 tB at
+
Donor Vector
Apr
Kmr
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Invitrogen 产品
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Invitrogen 产品
PCR 聚合酶 PCR SuperMix PCR 产物纯化试剂盒 胶回收试剂盒 两步RT-PCR 反应
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4 克隆
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2.1 逆转录
RNA为模板, 在反转录酶催化下, 由dNTP聚合成DNA的作用, 信息流从RNA到DNA, 与DNA到RNA的方向相反, 故称为逆转录.
逆转录酶
mRNA
cDNA
RNA指导下的DNA合成作用,合成的DNA与mRNA序列互补,称为互补DNA(cDNA)

克隆,是英文“clone”一词的音译,是利用生物技术由无性生殖产生与原个体有 完全相同基因组之后代的过程。 克隆一个基因是指从一个个体中获取一段基因(例如通过PCR的方法)然后将 其插入另外一个个体(通常是通过载体),再加以研究或利用。
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