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文档之家› 生物化学简明教程ppt 第二章蛋白质
生物化学简明教程ppt 第二章蛋白质
3、蛋白质的变性
(1)、变性的概念
在变性因素作用下,天然蛋白质一级结构保
持不变,高级结构发生了异常的变化,由天然态
的折迭态变成了变性的伸展态,引起生物功能的
丧失,理化性质的改变的现象。
氨基酸的甲醛滴定
* 反应特点 A.为α - NH2的反应 B.在常温,中性条件,甲醛与α - NH2很快反应,生成羟甲基衍生物,释放氢离子。 * 应用:氨基酸定量分析—甲醛滴定法(间接滴定) A.直接滴定,终点pH过高(12),没有适当指示剂。 B.与甲醛反应,滴定终点在9左右,可用酚酞作指示剂。 C.释放一个氢离子,相当于一个氨基(摩尔比1:1) D.简单快速,一般用于测定蛋白质的水解速度。
第四节
定义
蛋白质的结构
举例:胰岛素的一级结构
(一)、蛋白质的一级结构
(二)、空间结构包含的内容
1、蛋白质的二级结构 (1)、定义
α-螺旋结构 (2)、包含内容 β-折叠结构 β-转角结构 (3)、超二级结构: αα、 βαβ、βββ、 β曲折 (4)、结构域
2、蛋白质的三级结构 举例:鲸肌红蛋白的三级结构
脂肪族氨基酸
含酰基的氨基酸: 含一氨基二羧基的 酸性氨基酸: 含二氨基一羧基的 碱性氨基酸: Phe、Tyr
杂环族氨基酸: Trp、His、Pro
三、氨基酸的理化性质
1、一般物理性质 2、化学性质
与亚硝酸的反应 (1) 氨基参加的反应 与甲醛的反应 与2,4-二硝基氟苯的反应 与异硫氰酸苯酯的反应
与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应
• Edman (苯异硫氰酸酯法):由Edman于1950年首先 提出,为α- NH2的反应,用于N末端分析,又称 Edman降解法。此法的特点是能够不断重复循环,将 肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。
H
N C S
O CH C R1 R2
H
O NH CH C
氨基酸的两性解离
R R +
+
OHH+
CH NH3 COOH
+
CH NH3+ COO
+ OH+ H+ (pK´2)
R CH NH2 COO
pH< pI
净电荷为正
(pK´1)
pH = pI
净电荷=0
pH > pI
净电荷为负
pH = pI: 蛋白质处于中性环境,两边解离趋势相等而成兼性离子 pH > pI:蛋白质处于碱性环境,羧基解离趋势大于氨基而成负离子
三、根据功能分类
催化蛋白 调节蛋白 结构蛋白 运输蛋白 贮藏蛋白 运动蛋白 防御蛋白 电子传递蛋白
第二节 蛋白质的组成单位-氨基酸
一、氨基酸的结构
COOH
1、结构通式
H
C R
NH2
2、构型:L型、D型
二、氨基酸的分类
1、按R基的极性不同来分类
含脂肪烃R基:Gly、Val、Ala 非极性R基氨基酸 Leu、Ile、 含芳香环及杂环R基:Phe、 Trp、Pro
不带电荷的极性R基:Ser、Thr、
Asn、Gln、Tyr、Cys 极性R基氨基酸 带正电荷的极性R基:Lys、His、 Arg 带负电荷的极性R基:Asp、Glu
2、按R基的化学结构不同来分类
含一氨基一羧基的 中性氨基酸: 含羟基的氨基酸:
Gly、Ala、Val、Leu、Ile、 Cys、Met Ser、Thr、 Asn、Gln Asp、Glu Lys、Arg
一、蛋白质的性质
1、蛋白质的相对分子质量 沉降系数S
2 、蛋白质的两性解离和等电点
等电点isoelectric point:蛋白质分子所带的 正电荷和负电荷相等时溶液的pH值。 pI在有中性盐时有明显变化,因分子中某些
解离基团可与盐的离子如Ca2+、Mg2+、Cl-、
HPO42-结合,观察到的pI在一定程度上决定于介
时溶液的pH值即为该蛋白质的等电点 (isoelectric point,pI)。
β -转角(β -turn)
特征:多肽 链中氨基酸
残基n的羰基
上的氧与残 基 ( n+3) 的 氮原上的氢 之间形成氢
键,肽键回
折1800 。
五、 蛋白质的超二级结构和结构域
(1)超二级结构( supersecondary structure )
含长短不等的A、B、C、D、E、F、G、H 共8个
α-螺旋。分子中几乎80%的氨基酸残基都是位于α螺旋结构中。α-螺旋之间的拐弯处(AB、CD、EF、 FG、GH)是无规卷曲。绝大多数亲水性R侧链分 布在分子的外表面,与水分子结合,使肌红蛋白
可溶于水溶液中。绝大多数疏水性R侧链埋藏在分
子内部。
分子表面有一个深陷的洞穴。该洞穴由C、E、
形成因素:与AA组成和排 列顺序直接相关。
多态性:多数为右手(较稳 定),亦有少数左手螺旋存 在(不稳定 );存在尺寸不同
的螺旋。
*影响α- 螺旋形成的因素
氨基酸组成和序列? R基团? 脯氨酸?
-折叠
①定义:两条或几条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,相邻
肽链主链上的氨基和羰基之间形成有规则的氢键,维持这种片层结构的 稳定。
• Edman降解法的改进方法--- DNS-Edman降解法 – 用DNS(二甲基萘磺酰氯)测定N端氨基酸 • 原理DNFB法相同 • 但水解后的DNS-氨基酸不需分离,可直接用电泳或层析法 鉴定 • 由于DNS有强烈荧光,灵敏度比DNFB法高100倍,比 Edman法高几到十几倍 • 可用于微量氨基酸的定量
B.水解DNP-肽,得DNP-N端氨基酸及其他游离氨
基酸
C.分离DNP-氨基酸 D.层析法定性DNP-氨基酸,得出N端氨基酸的种 类、数目
Corey & Pauling
α-螺旋(α-helix)
特征:1、 每隔3.6个AA残 基螺旋上升一圈,螺距 0.54nm; 2 、 螺旋体中所有氨基 酸残基R侧链都伸向外侧, 链中的全部>C=0 和>N-H几 乎都平行于螺旋轴; 3、每个氨基酸残基的 >N-H与前面第四个氨基酸残 基的>C=0形成氢键,肽链上 所有的肽键都参与氢键的形 成。
第二章 蛋白质
蛋白质主要元素组成:C、H、O、N、S
及 P、
Fe、Cu、Zn、Mo、I、Se 等微量元素。•
蛋白质平均含N量为16%,这是凯氏定 氮法测蛋白质含量的理论依据: 蛋白质含量=蛋白质含N量×6.25
第一节
蛋白质的分类
一、根据分子形状分类
二、根据分子组成分类
单纯蛋白质(如清蛋白等) 结合蛋白质(如核蛋白等)
荷,在电场中向阴极移动。
*在一定pH范围中,溶液的pH离AA等电点愈远,AA带净电荷 愈多。
氨基酸等电点的计算
一氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
pK1+pK2
2
pK1+pKRCOOH
一氨基二羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
pK2+pKRNH2
二氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子状态两侧
蛋白质中相邻的二级结构单位(即单个α -螺旋或β -折叠或β
-转角)组合在一起,形成有规则的、在空间上能辩认的二级结构组
合体称为蛋白质的超二级结构 基本组合方式:α α ;β ×β ;β β β
(2) 结构域(structure domain)
在二级结构的基础上,多肽进一步卷曲折叠成几个相对独立、近
的基团pK′值之和的二分之一。
蛋白质两性解离性质和等电点
Pr
NH3
+
+ +
OHH+
Pr
NH3 COO-
+
+ OH+ H+
Pr
NH2 COO-
COOH
pH< pI
净电荷为正
pH = pI
净电荷=0
pH > pI
净电荷为负
当蛋白质溶液在某一定pH值时,使某特定蛋白质分子上所带正负
电荷相等,成为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此
3、蛋白质的四级结构
举例:血红蛋白的四级结构(亚基) 三、维持蛋白质构象的化学键
1、共价键:肽键、二硫键
2、非共价键:氢键、范德华力、
盐键(离子键)、疏水键
第五节 蛋白质结构与功能的关系
一、蛋白质一级结构和功能的关系 1、种属差异
2、分子病
二、蛋白质的空间结构与功能的关系 *别构现象
第六节 蛋白质的性质与分离、分析技术
似球形的三维实体,再由两个或两个以上这样的三维实体缔合成三级 结构,这种相对独立的三维实体称为结构域。
形成意义:
动力学上更为合理 蛋白质(酶)活性部位往往位于结构域之间,使其更具柔性
卵溶菌酶的三级结构中的两个结构域
结构域2结构域1来自-螺旋二硫键-转角 -折叠
a-氨基可与亚硝酸反应产生氮气
成盐和成脂反应 (2)羧基参加的反应 脱羧反应 (3)氨基和羧基共同参加的反应 两性解离(两性离子、两性解离、等电点) 茚三酮反应 成肽反应
(4)由侧链基团参加的反应
双缩尿反应 黄蛋白反应 乙醛酸反应 坂口反应 酚试剂反应 米伦氏反应
第三节
一、肽的结构
肽
几个重要的概念:肽、肽键、氨基酸 残基、N端C端、多肽、二硫键、 酰氨平面
第 四 节 蛋 白 质 的 二 级 结 构
一级结构
primary structure
二级结构
secondary structure 超二级结构 supersecondary structure 结构域 Structure doman Tertiary structure