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实验一质粒提取

②能自主复制,是能独立复制的复制子(autonomous replicon)。
③质粒对宿主生存并不是必需的。
Replication of plasmid
• stringent manner – 复制子(pSC101)的调节分子是RepA 蛋白,它对复制的起始具有正向作用,而对其自身基因的 转录具有负调控作用。严紧型质粒的复制需要蛋白质的不 断合成,这种质粒在每个细胞中只有1-5个拷贝。
溴化乙锭(ethidium bromide EtBr):0.5ug/ml
荧光染料,含有一个可以嵌入DNA堆积碱基 之间的一个三环平面基团。它与DNA的结合几 乎没有碱基序列特异性。
SYBR gold fluorescence dye:
是一种特有的能够激发荧光的非对称花青 染料。
• 其灵敏度更高 • 当被波长为300nm的透射光照射时,可
Relaxed manner – pMB1/colE1复制子
质粒的应用
• 质粒的特点使质粒成 为携带外源基因进入 细菌中扩增或表达的 重要媒介物,这种基 因运载工具在基因工 程中具有极广泛的应 用价值。
• 大多数基因工程使用 松弛型质粒。
常用质粒
pGEM®-7Zf(-) Vector circle map and sequence reference points
超螺旋DNA>线状DNA >开环DNA
2.凝胶浓度
3.电场强度
低电压时,迁移率与电压成正比。
当电压增大时琼脂糖凝胶分离的有效范 围反而减小。要获得大于2kb DNA片段的 良好分辨率,电压一般不超过 5V/cm。
4. 缓冲液离子强度
TAE 比 TBE TPE 快10% 三种的分辨率相近
凝胶上DNA的染色
重组质粒的构建包括质粒酶切、酶切产物目的片段的回收、回 收片段与载体连接等步骤,涉及一系列相互关联的酶促反应。
3. 电泳
背景知识
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖是D-和L-半乳糖残基通过α(1-3)β(1-4)交替构 成的线状聚合物。
Chemical Structure of Agarose
水平板凝胶电泳 垂直板凝胶电泳
• relaxed manner –在携带pMB1/colE1复制子的质粒中,正 向调节分子是一种RNA (RNAII),用作引发DNA前导链 的起始合成。其复制不需要任何质粒编码的蛋白质。完全 依赖于宿主提供的寿命较长的酶和蛋白质。每个细胞中有 15-20个拷贝。
• 通过对复制子改造,拷贝数能达到500-700 (例如 pPUC19)。
binding site of pUC/M13 Reverse Sequencing Primer 158–174
2. DNA重组
背景知识
外源DNA与载体分子的连接就是DNA重组,这样重新组合的 DNA叫做重组体或重组子。
重组的DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2 +、ATP存在 的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子 进行连接。
质粒是一种小的双链环状DNA分子,是独 立于细菌染色体外进行复制和遗传的辅助 性遗传单位。
用于基因克隆的载体
必须具备的条件:
1)能够在寄主细胞内独立自主复制; 2)具有可检测的选择性标记; 3)具有多克隆位点; 4)具有较高的外源DNA的载装能力; 5) 具有针对受体细胞的可转移性。
载体种类:有来自大肠杆菌的质粒、λ噬菌体、 M13噬 菌体、噬菌粒外,还有酵母、细菌人工染色 体载体以及动、植物病毒载体。
121–140
lacZ start codon
162
lac operator
182–198
β-lactamase (Ampr) coding region
1319–2179
phage f1 region
2363–2818
binding site of pUC/M13 Forward Sequencing Primer 2939–2955
背景知识
1. 质粒与载体
1952, J. Lederberg reviews the literature on cell heredity and suggests the term plasmid for all extrachromosomal hereditary determinants.
Pouring a Horizontal Agarose Gel
影响DNA在凝胶中迁移率的因素
样品的物理性状 凝胶浓度 电场强度 缓冲液离子强度
1.样品的物理性状
DNA分子的大小
迁移率与碱基对数的常用对数成反 比。分子越大,迁移得越慢。
DNA构象
超螺旋环状 线状DNA 切口环状
质粒分子,在一定条件下,泳动率的大 小顺序为:
T7 RNA polymerase transcription initiation site
1
SP6 RNA polymerase transcription initiation site
123
T7 RNA polymerase promoter (–17 to +3)
2982–3
SP6 RNA polymerase promoter (–17 to +3)
以发出量黄色荧光
• 1:10,000稀释使用,用电泳缓冲液当天 配置,室温存放。
模块一 重组质粒构建和重组子Байду номын сангаас筛选与鉴定
实验一 质粒DNA的提取和电泳检测 实验二 重组质粒的构建:酶切、目的片段回收、连接 实验三 大肠杆菌感受态细胞的制备及重组质粒的转化 实验四 重组质粒的鉴定
分子生物学与基因工程实验技术
前言
模块一 重组质粒构建和重组子的筛选与鉴定 模块二 植物遗传转化 模块三 转化烟草的鉴定
模块一 重组质粒构建和重组子的筛选与鉴定
实验一 质粒DNA的提取和电泳检测 实验二 重组质粒的构建:酶切、目的片段回收、连接 实验三 大肠杆菌感受态细胞的制备及重组质粒的转化 实验四 重组质粒的鉴定
Characteristics of plasmids
①是染色质外的双链共价闭合环形DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA),可自然形成超螺旋结构, 不同质粒大小在2-300 kb之间,<15kb的小质粒比较容易 分离纯化,>15kb的大质粒则不易提取。
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