• 暴露出的3端与另一个RNA基因组的3端配对. • 合成继续进行, 其产物两端都产生重复序列, 重复结构为 U3-R-U5. • 当反转录酶利用DNA产物为模板合成互补链时, 发生相 似的链转移. • 链转换是重组过程中的拷贝选择机制的一个例子.
反转录病毒RNA末 端为同向重复序列, 游离的线性DNA为 长末端重复序列 (LTR), 原病毒 DNA(整合的病毒 DNA)两末端是各 少两个碱基的LTR.
RETROVIRUSES AND RETROPOSONS 反转录病毒和反转录转座子
17.1 引言
• 反转录病毒是一个RNA病毒, 具有将它的序列反转 录成DNA的能力. • 反转录转座子是一个通过RNA形式进行移动的转座 子; DNA被转录为RNA, 然后被反转录成DNA, 并被 插入基因组新的位点. 这与反转录病毒的不同之处 在于反转录转座子没有一个有传染能力的(病毒)形 式.
17.4 Viral DNA is generated by reverse transcription. 反转录产生病毒DNA.
• 病毒RNA的每一个末端都有短重复序列(R), 因而5和3 端分别称为R-U5和U3-R.
• tRNA引物结合到5端的100-200位点后, 反转录酶开始合 成. • 当酶到达末端, RNA的5端就降解, 接着露出DNA产物的 3端.
• 线性DNA被反转录病毒的整合酶直接插入到宿主染 色体上.
• 整合过程中, 反转录病毒序列的两端各丢失2个碱基 对.
整合酶是整合反 应中唯一需要的 酶, 整合过程中, 每个LTR丢失2bp 后被插入到靶 DNA的4bp重复 序列之间.
17.6 Retroviruses may transduce cellular sequences. 反转录病毒能转导细胞基因组序列.
反转录病毒和反转录 转座子的繁殖周期包 括从RNA到DNA的反 转录和从DNA到RNA 的转录这个交替过程. 只有反转录病毒能产 生感染性颗粒, 而反 转录转座子只在细胞 内进行活动.
17.2 The retrovirus life cycle involves transposition-like events. 反转录病毒生命 周期包括转座事件.
• 典型的反转录病毒有3条基因: gag, pol, env. • Gag和Pol蛋白是由基因组的全长转录物翻译而来的. • Pol蛋白的翻译需要核糖体来进行移码. • Env是由剪接过程产生的一种独立的mRNA翻译而来 的. • 三种蛋白质产物的每一种都可由蛋白酶加工产生出 多种蛋白质.
反转录病毒的表达产物为多聚蛋白质, 经过加工后才成为单一蛋白质.

• 反转录病毒有单链RNA基因组的两份拷贝. • 整合的原病毒是双链DNA序列. • 反转录病毒通过将其基因组反转录而产生原病毒.
反转录病毒生活周期 中, 病毒的RNA基因组 经反转录成为双链体 DNA, 然后双链体 DNA插入宿主的基因 组中, 接着, 已整合的 DNA再转录出病毒 RNA.
17.3 Retroviral genes codes for polyproteins. 反转录病毒基因编码多聚蛋白质.
在反转录过程中, 经过转换模板来 产生负链DNA.
正链DNA的合成 需要第二次跳跃.
在反转录酶释放其 模板并以新的模板 继续合成DNA时, 拷贝选择重组就会 发生.
17.5 Viral DNA integrates into the chromosome. 病毒DNA整合到染色体中.
• 原病毒DNA在染色体上的组织与转座子相同, 在靶 位点, 原病毒的两侧都有短同向重复序列.
• 细胞RNA序列代替反转录病毒RNA的部分序列, 这种 重组事件会产生转化反转录病毒.
复制缺陷型转化 病毒的一段序列 被一段宿主序列 替换, 这种病毒 可以在一个功能 正常的辅助病毒 帮助下完成复制.
通过病毒基因组的整合 和缺失, 产生一个融合 的病毒-细胞转录物, 它 能被包装到正常的病毒 RNA基因组, 从而产生 了复制缺陷型病毒. 非 同源重组是产生缺陷型 的转化基因组所必需的.