第三章氨基酸
形成西佛碱
氨基酸与醛反应生成弱碱西佛碱 (Schiff's base),是以氨基酸为底
物的一些酶促反应的中间产物,如转
氨基。
二、羧基参与的反应
①.成盐和成酯反应 氨基酸和碱作用生成盐,其中重金属盐不溶 于水。氨基酸的羧基与醇作用形成酯。 ②.成酰氯反应
氨基酸的氨基如果被保护,例如被苄氧甲酰 基保护后,羧基可以与二氯亚砜或五氯化磷作用 生成酰氯。酰氯很容易去掉氯,而使该羧基与其 它氨基酸的氨基结合而使该羧基活化。这在多肽 人工合成中常用。
D. 测定范围:0.5~50µg/ml
E.脯氨酸与茚三酮直接生成黄色物质(不释放NH3)
* 应用:
A.氨基酸定量分析(先用层析法分离) B.氨基酸自动分析仪: 用阳离子交换树脂,将样品中的氨基酸分离,自动定 性定量,记录结果。
四、由侧链基团参加的反应
双缩尿反应 黄蛋白反应 乙醛酸反应 坂口反应 酚试剂反应 米伦氏反应
1、茚三酮在水溶液中变为水合 茚三酮。 2、氨基酸与水合茚三酮共热, 发生氧化脱氨、脱羧反应,生成 NH3和醛,放出CO2 。水合茚 三酮变为还原型茚三酮。
3、NH3与水合茚三酮及还原型 茚三酮脱水缩合,生成蓝紫色 化合物。
* 反应要点
A.该反应由NH2与COOH共同参与
B.茚三酮是强氧化剂 C.该反应非常灵敏,可在570nm测定吸光值
pH = pI
净电荷=0
pH > pI
净电荷为负
pH = pI: 蛋白质处于中性环境,两边解离趋势相等而成兼性离子 pH > pI:蛋白质处于碱性环境,羧基解离趋势大于氨基而成负离子
pH< pI: 蛋白质处于酸性环境,氨基解离趋势大于羧基而成正离子
三、氨基酸的两性解离性质及等电点
当氨基酸溶液在某一定pH值时,使某特定氨基酸分子上所带正 负电荷相等,成为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动 ,此时溶液的pH值即为该氨基酸的等电点(isoelectric point,pI)。
* 应用:鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸
首先由Sanger应用,确定了胰岛素的一级结构
A.肽分子与DNFB反应,得DNP-肽
B.水解DNP-肽,得DNP-N端氨基酸及其他游离氨
基酸
C.分离DNP-氨基酸 D.层析法定性DNP-氨基酸,得出N端氨基酸的种 类、数目
与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应
• Edman (苯异硫氰酸酯法):由Edman于1950年首先 提出,为α- NH2的反应,用于N末端分析,又称 Edman降解法。此法的特点是能够不断重复循环,将 肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。
H
N C S
O CH C R1 R2
H
O NH CH C
H N
H N C S: O R2
N C O
③.脱羧基反应
氨基酸在脱羧酶(amino acid decarboxylase)的 作用下,生成一级胺,这在氨基酸分解中介绍。 ④.叠氮反应 氨基酸的氨基通过酰化加以保护,羧基转变为 甲酯,然后与肼和亚硝酸反应形成叠氮化合物,这 其实是使羧基活化,常用于肽的人工合成。
三、氨基和羧基同时参与的反应
2、按R基的化学结构不同来分类
含一氨基一羧基的 中性氨基酸: 含羟基的氨基酸:
Gly、Ala、Val、Leu、Ile、 Cys、Met Ser、Thr、 Asn、Gln Asp、Glu Lys、Arg
脂肪族氨基酸
含酰基的氨基酸: 含一氨基二羧基的 酸性氨基酸: 含二氨基一羧基的 碱性氨基酸: Phe、Tyr、 Trp
紫外吸收光谱:色氨酸最大吸收波长为279nm,酪氨酸最 大吸收波长278nm,苯丙氨酸最大吸收波长为259nm。
280nm
275nm 257nm
Calculation of pI (2)
N+H3CH2CH2CH2CH2CHCOOH NH3 2 pK1 N+H3CH2CH2CH2CH2CHCOONH3 pK2 N+H3CH2CH2CH2CH2CHCOONH2 1 1 pKNH2 NH2CH2CH2CH2CH2CHCOONH2 1 2 1
Calculation of pI (3)
O NH CH C
N C
S
O CH C R2
HN CH C R1
NH NH C O 2 CH
R1
C NH CH R1
S
• • • • •
肽链(N端氨基酸)与PITC偶联,生成PTC-肽 环化断裂:最靠近PTC基的肽键断裂,生成PTC-氨基酸和少 一残基的肽链,同时PTC-氨基酸环化生成PTH-氨基酸 分离PTH-氨基酸 层析法鉴定
杂环族氨基酸: His、Pro
第三节
氨基酸的酸碱化学
一、氨基酸的兼性离子形式:
氨基酸或肽在晶体或水中以兼性离子形式 存在,熔点高。
二、氨基酸的两性解离
R R +
+
OHH+
CH NH3 COOH
+
CH NH3+ COO
+ OH+ H+ (pK´2)
R CH NH2 COO
pH< pI
净电荷为正
(pK´1)
HOOCCH2CH2CHCOOH NH3 1 pK1 HOOCCH2CH2CHCOONH3 pKCOOH -OOCCH2CH2CHCOO NH3 2 1
-
1
1
pk3 pK2
-OOCCH2CH2CHCOONH2 2
例题与习题:
现在有四个氨基酸:苯丙氨酸pI=5.5、脯氨酸pI=6.3、门冬 氨酸pI=2.8和赖氨酸pI=9.7,请问在以下pH条件下进行电 泳,各氨基酸的主要存在形式是什么?在外电场作用下, 移向阳极还是阴极? 苯丙氨酸 (1)pH=7.0 (2)pH=6.0 (3)pH=5.0 负 阳极 负 阳极 正 阴极 正 阴极 脯氨酸 负 阳极 正 阴极 正 阴极 正 阴极 门冬氨酸 负 阳极 负 阳极 负 阳极 正 阴极 赖氨酸 正 阴极 正 阴极 正 阴极 正 阴极
一氨基二羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
pK2+pKRNH2
二氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
2
可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子状态两侧
的基团pK′值之和的二分之一。
Calculation of pI (1)
H H3 N C COOH CH3 low pH 电荷 编号 1 Ⅱ pK1 H NH3 C COO CH3 pI 1 1 Ⅰ pK2 H NH2 C COO CH3 high pH 1 Ⅲ
(4)pH=2.0
四、氨基酸的甲醛滴定
* 反应特点 A.为α - NH2的反应 B.在常温,中性条件,甲醛与α - NH2很快反应,生成羟甲基衍生物,释放氢离子。 * 应用:氨基酸定量分析—甲醛滴定法(间接滴定) A.直接滴定,终点pH过高(12),没有适当指示剂。 B.与甲醛反应,滴定终点在9左右,可用酚酞作指示剂。 C.释放一个氢离子,相当于一个氨基(摩尔比1:1) D.简单快速,一般用于测定蛋白质的水解速度。
第四节
氨基酸的化学反应
与亚硝酸的反应
一、 氨基参加的反应
与酰化试剂的反应 烃基化反应 形成西佛碱反应 脱氨基反应
a-氨基可与亚硝酸反应产生氮气
与酰化试剂的反应(略)
氨基酸的氨基在弱碱溶液中与酰氯或酸酐反
应时,氨基被酰基化。这些酰化试剂有:苄氧
(苯甲氧)甲酰氯(carbobenzyloxychloride);
第三章 氨基酸
第一节 蛋白质的组成单位-氨基酸
COOH
氨基酸的结构通式
HCNH2R第二节 氨基酸的分类
1、按R基的极性不同来分类
含脂肪烃R基:Met、Val、Ala 非极性R基氨基酸 Leu、Ile、 含芳香环及杂环R基:Phe、 Trp、Pro
不带电荷的极性R基:Ser、Thr、
Gly、 Asn、Gln、Tyr、Cys 极性R基氨基酸 带正电荷的极性R基:Lys、His、 Arg 带负电荷的极性R基:Asp、Glu
*在氨基酸等电点以上任何pH,AA带净的负电荷,在电场中 向阳极移动;在氨基酸等电点以下任何pH,AA带净的正电
荷,在电场中向阴极移动。
*在一定pH范围中,溶液的pH离AA等电点愈远,AA带净电荷 愈多。
氨基酸等电点的计算
一氨基一羧基AA 的等电点计算:
pI=
pK1+pK2
2
pK1+pKRCOOH
第五节 氨基酸的光学活性和光谱性质
AA的α-碳原子是手征性(chirality)碳原子,与 它相连接的四个基团不一样,化学上以乳酸作为标 准,规定手征性碳原子的氨基酸的对应异构体。 D型表示右旋(destro)的意思,L型表示左旋 (levo),组成蛋白质的氨基酸都是L型的。
甘氨酸没有D和L之分,其α-C结合的四个基团 有两个一样,都是氢原子。
• Edman降解法的改进方法--- DNS-Edman降解法 – 用DNS(二甲基萘磺酰氯)测定N端氨基酸 • 原理DNFB法相同 • 但水解后的DNS-氨基酸不需分离,可直接用电泳或层析法 鉴定 • 由于DNS有强烈荧光,灵敏度比DNFB法高100倍,比 Edman法高几到十几倍 • 可用于微量氨基酸的定量
叔丁氧甲酰氯(tertiary butyloxycarbonyl);对甲
苯磺酰氯(p-toluenesulfonyl chloride);邻苯二 甲酸酐(phthalic anhydride);丹磺酰氯(dansyl chloride)
与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应
* 反应特点 A.为α- NH2的反应 B.氨基酸α- NH2的一个H原子可被烃基取代(卤代烃) C.在弱碱性条件下,与DNFB发生芳环取代,生成二硝基 苯氨基酸