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基因多态性与疾病发生遗传易感性_深圳

根据基因结构的改变方式,基因突变可分为碱基置换突 变和移码突变两种类型:
碱基置换突变:由一个错误的碱基对替代一个正确的碱基对的 突变叫碱基置换突变。碱基替换过程只改变被替换碱基的那个 密码子,也就是说每一次碱基替换只改变一个密码子,不会涉 及到其他的密码子。
移码突变:基因中插入或者缺失一个或几个碱基对,使DNA的 阅读框架(读码框)发生改变,导致插入或缺失部位之后的所 有密码子都跟着发生变化,结果产生一种异常的多肽链。
基因多态性 与疾病发生遗传易感性
Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
2020/8/6
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提纲
1. 单核苷酸多态性 Single Nucleotide Polymorphism
2. 基因多态性与疾病发生遗传易感性 Gene Polymorphism and Genetic Susceptibility to Disease
3. 基因多态性与基因转录调控 Gene Polymorphism and Regulation of Gene Transcription
4. 展望 Future Prospects
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DNA Structure
基因突变
基因突变(mutation):由于DNA碱基对的置换、插入或 缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。
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基因突变
根据遗传信息的改变方式,基因突变又可以分为同义突变、错义 突变和无义突变三种类型:
同义突变:DNA的一个碱基对的改变并不会影响它所编码的蛋白 质的氨基酸序列,这是因为改变后的密码子和改变前的密码子是简 并密码子,它们编码同一种氨基酸,这种基因突变称为同义突变。
错义突变:由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变为决定另一种氨基酸的密码子的基因突变叫错义突变。这种 基因突变有可能使它所编码的蛋白质部分或完全失活。
无义突变:由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密 码子变成一个终止密码子的基因突变叫无义突变。
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单核苷酸多态性
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs): 是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已 知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均 每500-1000个碱基对中就有1个,人类30亿碱基中大约有1000 万个SNPs。
SNP所表现的多态性可以只涉及到单个碱基的变异,这种变 异可由单个碱基的转换(transition,嘌呤>嘌呤或嘧啶>嘧啶) 或颠换(transversion,嘌呤<—>嘧啶)所引起,也可由碱基的 插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。
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单核苷酸多态性
理论上,SNPs可以分二、三和四等位基因,但人类一 般为二等位基因(biallelic)。二等位基因有4种不同类 型,包括1种转换C>T (G>A)和3种颠换C>A (G>T)、 C>G (G>C)、T>A (A>T)。四种SNPs类型在人类中的发 生频率不同,最常见的为C>T (G>A)转换,约占2/3,其 它3种类型发生的频率相同。之所以转换几率高,可能 是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中最 易发生突变的位点,其中大多数是甲基化的,可自发地 脱去氨基而形成胸腺嘧啶。
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单核苷酸多态性
人类基因组SNPs研究所揭示的人种、人群和个体之间DNA 序列的差异以及这些差异所表现的意义将对疾病的诊断、 治疗和预防带来革命性的变化。
SNPs应用
多基因病和复Biblioteka 性疾病如人类肿瘤、糖尿病、自身免疫性疾病、 老 年 性 痴 呆 等 的 遗 传 连 锁 分 析 (linkage analysis) 及 关 联 分 析 (association analysis),用于疾病易感基因定位和克隆。
“药物基因组学”(pharmacogenomics)研究中用于揭示人群中不 同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因。
SNPs,cSNPs)、基因周边SNPs(Perigenic SNPs,pSNPs)以及 基因间SNPs(Intergenic SNPs,iSNPs)等三类。 SNPs在基因组中的分布十分广泛,但不同的区域出现的频率不同。 人类单碱基等位基因十分稳定。 人类SNPs大部分(85%)是共有的。
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单核苷酸多态性
SNPs分布区域:
63% Intronic(内含子) 24% Locus region(基因座区) 11% Untranslated region(非翻译区) 1% Nonsynonymous(nsSNPs,错义SNPs) 1% Synonymous(同义SNPs) <1% Splice site(剪接位点) <1% Unknown coding variant(不明编码变异)
单核苷酸多态性
人类基因组中大约估计每个基因有2个常见的错义突变 在公共数据库中至少有500万个SNPs。 仅有少量(可能为50,000–250,000)SNPs在一定程度上(小到中等
度)能反映与疾病发生危险相关的表型。 根据SNP在基因中的位置,可分为基因编码区SNPs(Coding-region
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单核苷酸多态性
Example of an SNP comprising a G>A substitution Electropherograms produced by fluorescence-based sequencing using an ABI 3700 showing the genomic DNA from an individual homozygous for G at the site of the SNP (a) and an individual homozygous for A (b). The base substitution is denoted by an arrow.
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