当前位置:文档之家› 临床常见曲霉菌体外药物敏感性和分子生物学鉴定方法研究

临床常见曲霉菌体外药物敏感性和分子生物学鉴定方法研究

由低到高依次为卡泊芬净、泊沙康唑、伏立康唑、伊曲康唑、两性霉素B;土曲霉 对两性霉素B的MIC均>32岭/ml。MaSterPure刑Yeast
DNA Purification
Kit提取的
DNA量很低,固体培养+液氮研磨方法、液体培养+液氮研磨方法以及固体培养+液
氮研磨+试剂盒纯化方法提取的DNAOD26徊D280的均值分别为1.73、1.96和1.80。烟
caspo劬gill t0彳印P喇Z如堪印弘comInoIlly encouIltered in cliIlical∞tting龇1d to e啦lbliSh
a11d eVaLluate

real—tiIlle PCR觞say for identification
of么印P呼刀搬互阳.t0
Species leVel.
straills)、Ⅳere锄plified
by
common
PCR
弱say.
Species—Specific probes、№re t11en co砌;irmed a11d modified according t0 sequences acquired for
by∞quencing
of ITS regio璐.Afber
第三部分曲霉菌DNA提取方法和真菌菌种保藏方法的初步探索………23
第四部分实时荧光PCR鉴定曲霉菌方法的建立及评价……………..34 全文结论………………………………………………..68 文献综述………………………………………………..70 参考文献………………………………………………..77 缩略词表………………………………………………..85 论文列表………………………………………………..86 个人简历………………………………………………..87
Ⅱle 5
孤ti劬gal
agents
i芏1cluding
Voriconazole,
i仃ocon鼬role,龇n1)ho钯riciIl
posacon锄le and caSpo劬gin.CollSequently,ITS regioIlS in曲osome DNA(rDINA)of
仕le

4妒P曙fⅣ淞置印. (47
曲霉、黄曲霉、黑曲霉、构巢曲霉种特异性探针Tm值分别为61.4℃、57.4℃、67.7℃、 65.8℃,土曲霉特异性探针的Tm值为64.5℃和55.2℃。实时荧光PCR方法对烟曲 霉、黄曲霉、黑曲霉、土曲霉、构巢曲霉的检测下限分别为56.8龟、1110龟、13.7龟、 123龟、780龟。疣状瓶霉和小孢根霉能与烟曲霉特异性探针发生交叉反应。该方法 在每次重复实验中Tm值的波动在O.5℃以内。
nl巩a
real-劬e PCR嬲say w嬲established
real-time
identific撕on of彳印P曙川嬲暖p
FinallyΒιβλιοθήκη 吐1et0 species level by廿le probes’speci丘c nlelting
【结果】形态学观察基本上能将临床常见的5种曲霉菌鉴定到种,对于其他种属形 态学可以将其鉴定到属的水平,但是较难鉴定到种。卡泊芬净对烟曲霉、黄曲霉、
构巢曲霉的MIC90均为O.094“g枷,对黑曲霉的MIC90为O.19pg/ml,在5种药物中最
低;泊沙康唑对土曲霉的MIC90最低,为0.094“咖l;对于烟曲霉和黄曲霉,MIC90
【方法】对所收集的真菌通过形态学和/或分子生物学鉴定,采用浓度梯度法(E.test) 测定伏立康唑、伊曲康唑、泊沙康唑、两性霉素B及卡泊芬净对5种曲霉菌的最低 抑菌浓度(MIC);采用液氮研磨、试剂盒纯化方法提取曲霉菌细胞核DNA,普通 PCR方法扩增5种(47株)曲霉菌的内转录间隔区(ITS),测序获得ITS区序列, 基于不同种曲霉菌的ITS区序列对种特异性探针进行验证和改进,建立实时荧光 PCR方法将常见曲霉菌通过特异性探针解链温度(Tm)的差异进行区分并对该方 法的灵敏度、特异性及重复性进行评价。
北京协和医学院硕士研究生学位论文
【结论】形态学结合rDNAITS区测序对真菌种的鉴定很有帮助。Etest法体外药敏 结果显示,新的棘白素类抗真菌药物卡泊芬净对五种曲霉具有很好的体外抗菌活 性,唑类药物对于曲霉菌的体外抗茵活性优于两性霉素B。采用固体培养+液氮研 磨法+试剂盒纯化法能获得高纯度的曲霉菌DNA。实时荧光PCR方法具有很好的灵 敏度、特异性和重复性,能将临床常见的5种曲霉鉴定到种的水平。
致 声
谢………………………………………………..89 明………………………………………………..90
北京协和医学院硕士研究生学位论文
中文摘要
【目的】探讨临床常见曲霉菌(烟曲霉、黄曲霉、黑曲霉、土曲霉、构巢曲霉) 对经典的抗真菌药物伏立康唑、伊曲康唑、两性霉素B和新的抗真菌药物泊沙康唑、 卡泊芬净的体外敏感性:建立应用实时荧光PCR技术将临床常见曲霉菌鉴定至种 的水平。
【关键词】曲霉菌;鉴定:实时荧光PCR;种特异性探针;解链曲线分析

北京协和医学院硕士研究生学位论文
Abstract
【objective】T0
mestigate恤iIl vi仃0枷劬gal Susc印曲ili够of classic趾d e雠rging
枷丘mgal age船such嬲voriconazole,itroconazole,a叫)hotericill B,posacomzole锄d
目录
中文摘要…………………………………………………1 英文摘要…………………………………………………3
前 刖
言…………………………………………………5 青…………………………………………………b
第一部分菌株收集及鉴定……………………………………7 第二部分抗真菌药物体外敏感性研究………………………….15
【Methods】FuIlgi
were identified
by
In0印hology aIld molecular
bi010盯before iIl vi仃0
of
B,
a11ti劬gal Susceptibil时testing.E-test meⅡ10d w嬲employed for MIC detemlination
相关主题