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分子生物学基本技术

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问题与讨论:
1.简要叙述溶液Ⅰ、溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的作 用,以及实验中 分别加入上述溶液后,反应 体系出现的现象及其成因。
2.简要叙述酚氯仿抽提DNA体系后出现 的现象及其成因。
3. 沉淀DNA时为什么要用无水乙醇及在高 盐、低温条件下进行?
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个人观点供参考,欢迎讨论!
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☆原理示意图 返回目录 返回原理
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——三个基本步骤:
细菌的生长和质粒的扩增 菌体的收集裂解及质粒DNA的分离 质粒DNA的纯化
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实验试剂
LB培养基:
胰化蛋白胨 10g
酵母提取物 5g 定容
1000ml pH
7.5
NaCl
10g
STE:
0.1M
NaCl
10mM
Tris HCl(pH8.0)
2.取1.5ml培养液至Eppendorf管中,12000g离心30秒, 弃上清,用1ml STE悬浮菌体,再离心回收菌体,并重复 一次,弃上清,取沉淀。
3.将细菌沉淀悬浮于100μl预冷溶液Ⅰ中,振荡混匀,冰 上放置5分钟。
4.加入200μl溶液Ⅱ,盖严管盖轻柔颠倒5次以混匀内容 物,冰上放置5分钟。
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碱变性法基本原理
在pH 12.0-12.6碱性环境中,线性的大分子量细菌 染色体DNA变性,而共价闭环质粒DNA仍为自然状 态。
将PH调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体 DNA之间交联形成不溶性网状结构,大部分DNA和 蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒 DNA仍为可溶状态,通过离心可除去大部分细胞碎 片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上 清中,再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。
5.加入150μl溶液Ⅲ,温和振荡数次,冰上放置5分钟。 6.12000g 4 ℃离心5分钟,取上清移到1个新的
Eppendorf管中。
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(7.加入等体积酚/氯仿(1:1),振荡混匀,12000g 4 ℃离心2分钟。取上清移至另1个Eppendorf管中。)
8.加入2倍体积无水乙醇,振荡混匀,于室温静置2分钟。 9. 12000g ,4 ℃离心5分钟。 10.弃上清,加入1ml 70%乙醇漂洗沉淀,盖严管盖颠
分子生物学基本技术(一)质粒的提取(源自法)三峡大学生物化学教研室
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实验目的
了解碱法提取质粒的原理; 掌握碱法提取质粒的方法。
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一.实验背景
质粒是染色体外的DNA分子,大小可为 1kb到200kb。
大多数来自细菌的质粒是双链、共价闭合 环状的分子,以超螺旋形式存在。它是细 菌内的共生型遗传因子。
1mM
EDTA
AmP 50mg/ml
溶菌酶 10mg/ml (用10mM Tris·HCl pH8.0新鲜配制)
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试剂
溶液Ⅰ: 50mM 葡萄糖 25mM Tris·HCl(pH8.0) 10mM EDTA
溶液Ⅱ:(新鲜配制) 0.2N NaOH 1% SDS
溶液Ⅲ: 5M KAC 10ml 冰醋酸 11.5ml 水 28.5ml
酚,氯仿,乙醇 RNase 琼脂糖 TE: 10mM Tris-HCl(pH8.0) 1mM EDTA
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实验仪器
(一) 仪器 1. 恒温摇床 2. 超净工作台 3. 高压灭菌锅 4. 高速台式离心机 5. 微量取液器
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Insert
EcoR1 1.9kb
Xho1
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三.实验方法
1.挑取琼脂培养板上的单菌落至5ml LB培养液中(含 AmP 50μg/ml), 37℃强烈摇荡过度。
倒数次,12000g 于4 ℃离心2分钟。 11.弃上清,抽干乙醇,室温干燥(5-15分钟)。 12.加入50μl TE(含20μg/ml RNA 酶,不含DNA酶)
溶解DNA。
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四.结果分析
1.质粒DNA OD260,OD280的值,由此 计算质粒DNA得率和DNA纯度。
2.记录电泳结果并说明结果内容。
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质粒的应用
大多数基因工程使用松弛型质粒。 严紧型质粒用来表达一些可使宿主细胞受毒
害致死的基因。
质粒的特点使质粒成为携带外源基因进入细 菌中扩增或表达的重要媒介物,这种基因运 载工具在基因工程中具有极广泛的应用价值。
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质粒提取的思路
质粒的特性:共价、闭合、环状的小分子量DNA 要去除的物质:
蛋白 基因组DNA 脂类及小分子杂质 RNA
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分离质粒DNA方法
从大肠杆菌中分离质粒DNA方法众多,目前常用的 碱变性法; 煮沸法; SDS法; 羟基磷灰石层析法等 各方法分离是依据宿主菌株类型、质粒分子大小、
碱基组成及结构等特点加以选择的,其中碱变性法 既经济且收得率较高,提取的质粒DNA可用于酶切, 连接与转化。
其复制和遗传独立于细菌染色体,但复制 和转录依赖于宿主编码的蛋白和酶。
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质粒特点
质粒能在细菌中垂直遗传并且赋予宿主细胞 一些表型,是比病毒更简单的原始生命。
质粒通过细菌的结合作用,从雄性体转移到 雌性体, 是细菌有性繁殖的性因子.
1952年由Lederburg正式命名为质粒。
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结构的三大要素: • 多克隆位点 • 选择标记(耐药性,LacZ) • 独立的复制单位 种类: • 质粒 • 噬菌体 • 酵母人工染色体(YAC) • 反转录病毒载体 • 表达载体等
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质粒类型
质粒按复制方式分为两种类型: 松弛型质粒 和 严紧型质粒
1.松弛型质粒
松弛型质粒的复制不需要质粒编码的功能蛋白, 完全依赖于宿主提供的半衰期较长的酶。即使蛋白 质合成受抑制,质粒的复制依然进行。
2.严紧型质粒
严紧型质粒复制需要一个质粒编码的蛋白,质粒的 拷贝数不能通过用氯霉素等蛋白合成抑制剂来增加。
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