白质学
蛋白质组学
研究策略及应用
孙海丹
2010.4.15
华大蛋白
蛋白质组学研究背景
蛋白质组学研究策略
蛋白质组学的应用
华大蛋白
蛋白质组学研究背景
系统生物学
华大蛋白
蛋白质组学研究背景
蛋白质组学
系统识别一个细胞或组织中表达的每一个蛋白质，以及确定每个蛋白质的特征。

例如：丰度、修饰状态、蛋白质复合体中的状态。

分析的技术包括蛋白质和肽的分离方法、识别和定量的鉴定与分析方法、数据管理和分析的生物信息学。

量的鉴定与分析方法数据管理和分析的生物信息学。

华大蛋白
蛋白质组学研究背景
2001年，国际人类蛋白质组成立，同时启动了人类蛋白质组计划(HPP)。

了人类蛋白质组计划(HPP)
中国：人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)、
中国：人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)
美国：人类血浆蛋白质组计划(HPPP)、
德国：人类脑蛋白质组计划(HBPP)、
德国人类脑蛋白质组计划(HBPP)
瑞士：大规模抗体计划、
英国：蛋白质组标准计划(PSI)、
英国蛋白质组标准计划(PSI)
加拿大：模式动物蛋白质组计划、
本白质组计划
日本：糖蛋白质组计划。

华大蛋白
蛋白质组学研究策略
Top-Down
华大蛋白
蛋白质组学研究策略
Bottom-Up
华大蛋白
蛋白质组学常用技术
基于二维凝胶的定量：2DE
华大蛋白
蛋白质组学常用技术
基于二维凝胶的定量：2DE
染色方法：考马斯亮蓝染色
银染
荧光染色
华大蛋白
蛋白质组学常用技术
基于二维凝胶的定量：2D DIGE
基于二维凝胶的定量：2D DIGE
华大蛋白
蛋白质组学常用技术
基于二维凝胶的定量：2D DIGE
基于二维凝胶的定量：2D DIGE
华大蛋白
蛋白质组常用技术
基于质谱数据的定量：
华大蛋白
Mass
S t t
HPLC
Spectrometer
di ti
digestion
identification
MS spectra
quantification
and MS/MS spectra
characterization
P
O
translational
… post translational
华大蛋白
蛋白质组学常用技术
基于质谱数据的定量
、、、
标记：ICPL、ICAT、SILAC、iTRAQ
非标记：MRM、Spectrum Counts
华大蛋白
定量蛋白质组常用技术
ICAT
华大蛋白
定量蛋白质组常用技术
ICPL
华大蛋白
定量蛋白质组常用技术
SILAC
华大蛋白
定量蛋白质组常用技术
iTRAQ
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
蛋白质表达谱
肿瘤蛋白质组
血浆蛋白质组
植物蛋白质组
微生物蛋白质组
亚细胞器蛋白质组
互作蛋白质组
修饰蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
蛋白质测序
多肽组
代谢组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
蛋白质表达谱
后基因组时代,利用表达谱信息进行基因功能深层预测。

HLPP
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
肿瘤蛋白质组
肺癌
胃癌
结肠癌
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
肿瘤蛋白质组------肺癌分泌蛋白质组
97kDa 97kDa
66kDa 44kDa 66kDa 44kDa
30kDa 30kDa
20kDa 14kDa 20kDa 14kDa
早期代龄细胞晚期代龄细胞
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
肿瘤蛋白质组------血清肺癌标志物
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用肿瘤蛋白质组------胃癌蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用肿瘤蛋白质组------结肠癌肝转移
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
植物蛋白质组学------水稻胚胎发育差异蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
植物蛋白质组学------水稻胚胎发育差异蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
植物蛋白质组学------水稻胚胎发育差异蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
微生物蛋白质组学------腾冲噬热菌蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
微生物蛋白质组学------海栖热孢菌蛋白质组
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用微生物蛋白质组学------猪链球菌免疫差异谱的分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
亚细胞器蛋白质组学
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
亚细胞器蛋白质组学------线粒体蛋白质组分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
亚细胞器蛋白质组学------线粒体蛋白质组分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
亚细胞器蛋白质组学------线粒体蛋白质组分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用亚细胞器蛋白质组学------线粒体蛋白质组分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用互作蛋白质组学
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
修饰蛋白质组学
糖基化
磷酸化
硝基化
乙酰化
……
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
修饰蛋白质组学------糖基化
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用质谱成像
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用人前列腺癌组织
HE staining MALDI
质谱成像
HE staining MALDI 华大蛋白
蛋白质组学研究的应用 1.00e n 液体芯片
t 04x10]s 1.5
n 样品的质谱图
华大蛋白
蛋白质组学研究的应用
液体芯片
软件自动提取可用峰
差异分析
华大蛋白
蛋白质组学研究的关键步骤
样品制备
华大蛋白
蛋白质组学研究的关键步骤 样品制备
蛋白质组学研究的关键步骤 样品制备------亲和富集
华大蛋白
蛋白质组学研究的关键步骤 样品制备ProteoMiner
华大蛋白
蛋白质组学研究的关键步骤
样品制备
CLINPROT Magnetic Beads
华大蛋白
蛋白质组学研究的关键步骤
研究策略的选择
华大蛋白。