第3章蛋白质化学答案第3章蛋白质化学答案第三章、蛋白质化学(一)氨基酸化学部分1、名称表述解:必需氨基酸:机体不能自行合成而必须从外界食物摄取的氨基酸。
ilemetvalleutrpphethrlys,对婴儿还有:arg、his。
非必需氨基酸:能够在人体内利用糖代谢中间产物转氨促进作用制备的氨基酸。
消旋作用:旋光性物质在化学反应中,其不对称原子经过对称状态的中间阶段,失去旋光性的作用。
消旋物:旋光性物质在化学反应中,产生d-型和l-型的等摩尔混合物,丧失旋光性的促进作用。
2、结构式丙氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、甘氨酸、丝氨酸、谷氨酸、天冬氨酸。
3、为什么共同组成蛋白质的基本单位就是氨基酸。
根据氨基酸侧链r基的极性可以分成哪几类?解:蛋白质水解产物是氨基酸。
分类:(1)非极性r基氨基酸(8种):脂肪烃侧链的氨基酸(丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和脯氨酸);芳香族氨基酸:(苯丙氨酸、色氨酸);甲硫氨酸(蛋氨酸)。
(2)、不拎电荷的极性r基氨基酸:7种;甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸(3)、拎正电荷的r基氨基酸:碱性氨基酸,3种;赖氨酸、精氨酸、组氨酸。
(4)、拎负电荷的r基氨基酸:酸性氨基酸,2种;谷氨酸、天冬氨酸。
4、比较几种蛋白质水方法的特点。
求解:(1)、酸水解:产物不消旋,为l-氨基酸;色氨酸被全然毁坏;部分水解羟基氨基酸(丝氨酸或苏氨酸)被毁坏;asn、gln被毁坏。
(2)碱解:消旋,产物为d-和l-氨基酸的混合物;多数氨基酸破坏;色氨酸不被破坏(3)酶求解:不消旋,产物为l-氨基酸;不毁坏氨基酸;须要几种酶共同促进作用5、以芳香族氨基酸为基准表明其光吸收特点。
解:在可见光没有光吸收;在紫外部分有特征光吸收,酪氨酸275nm,苯丙氨酸257nm,色氨酸280nm。
6、何为氨基酸等电点?氨基酸在等电点时存有什么特性。
解:等电点:氨基酸处于正负电荷数相等即净电荷为零的兼性离子状态时溶液的ph 值。
等电点时氨基酸的性质:溶解度最轻,可以拆分相同氨基酸。
ph=pi,氨基酸在电场中既不向负极也不向负极移动。
ph>pi,氨基酸拎净负电荷;ph<pi,氨基酸拎净正电荷。
7、叙述氨基酸和下列物质反应的化学本质,说明反应在生物化学领域的应用。
解:亚硝酸:室温下,氨基酸与亚硝酸作用,很快生成氮气。
可用于测游离aa含氮量和蛋白质的水解程度。
甲醛:氨基酸的氨基与甲醛反应分解成羟甲基氨基酸和二羟甲基氨基酸,并使反应向释出质子的方向移动,酸性减少,ph减少,需用氢氧化钠电解测游离aa含氮量和蛋白质的水解程度。
茚三酮:在弱酸溶液中与a-氨基酸共冷,氨基酸即为被水解脱氨产生酮酸,酮酸脱羧成醛;茚三酮则被还原成为还原成茚三酮,再与茚三酮、氨促进作用产生蓝紫色物质。
常用于氨基酸和蛋白质的定性或定量分析。
8、排序甘氨酸、赖氨酸和谷氨酸的等电点。
求解:甘氨酸:pi=(2.34+9.60)/2=5.97赖氨酸:pi=(8.95+10.53)/2=9.74。
谷氨酸:pi=(2.19+4.25)/2=3.22。
9、、欲在ph6.0的正丁醇体系中,利用纸层析分离氨基酸,恳请推论以下氨基酸的rf的顺序并表明原因,val、leu、asp、ser。
解:滤纸纤维上的羟基具有亲水性,因此吸附一层水作固定相,有机溶剂作流动相。
rf和氨基酸的极性有关,极性越小rf越大。
氨基酸的极性和侧链r的电荷、清水基团、大小有关。
在ph6.0时,asp侧链带电荷,ser侧链有羟基,val的侧链比leu小。
所以rf从大到小的顺序为:leu、val、ser、asp。
10、欲在ph6.0的缓冲液中,利用色谱法层析分离氨基酸,恳请推论以下氨基酸的洗清顺序并表明原因,leu、asp、ser,lys。
解:氨基酸的阳离子和阴离子在一定ph溶液中能同离子交换剂进行离子交换。
在酸性溶液中(对氨基酸的等电点而言)氨基酸本身为阳离子,能同阳离子交换剂(以ma代表)交换阳离子;在碱性溶液中其本身为阴离子,能同阴离子交换剂(以mb代表)交换明离子。
与离子交换剂结合的氨基酸经适当电解质溶液洗脱,氨基酸离子又会重新交换出来,亲和力小的氨基酸(和电荷、极性有关)先被洗脱下来.这样.就可使溶液中的各种氨基酸彼此分开。
在ph6.0时,氨基酸拎正电荷从少至小的顺序为:asp、leu-ser、lys。
而ser侧链有亲水基团,极性比leu大。
所以,洗脱顺序为:asp、ser、leu、lys。
(二)蛋白质部分1、解释下列名词求解:蛋白质一级结构:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中aa的排序顺序和二硫键的边线。
肽平面:-co-nh-中的四个原子和与它相邻的两个ca组成的平面。
蛋白质二级结构:多肽链的主链在一级结构的基础上,以肽键平面为基本单位的肽链通过氢键形成而折叠、盘曲形成的主链构象。
有α-螺旋,β-折叠,β-转角结构和无规则卷曲等。
β-转角:蛋白质分子多肽链上发生180°的回折叫做β-转角结构,蛋白质三级结构:多肽链在二级结构、超二级结构、结构域的基础上,进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。
是多肽链上的所有原子(包括主链和侧链)在三维空间的分布。
蛋白质四级结构:蛋白质的四级结构:是指蛋白质亚基的相互关系,空间的排列,亚基间通过非共价键聚合而成的具有完整地生物学活性的特定构象。
逊于二级结构:指若干相连的二级结构中的构象单元彼此相互作用,构成规则的,在空间上能辨识的二级结构组合体。
双缩脲反应:2分子双缩脲与碱性硫酸铜作用,生成粉红色复合物。
蛋白质的肽链有此反应盐析:向蛋白质溶液中加入大量的中性盐(硫酸铵、硫酸钠或氯化钠等)后可以吸去乳胶外层的水、减低蛋白质与水的亲和力而使蛋白质沉淀,此作用称盐析。
,结构域:指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上,进一步卷曲、折叠形成几个相对独立、紧密球状实体。
在空间上彼此分隔,各自具有部分生物功能的结构。
前体蛋白:由两个或多个亚基共同组成的蛋白质。
具备四级结构的蛋白属前体蛋白或多体蛋白。
盐溶:溶液中低浓度的中性盐能增加蛋白质溶解度的现象透析:根据蛋白质不能通过半透膜的性质,将待提纯的蛋白质溶液装在半透膜的透袋里放在蒸馏水中,外液不断更换,直至透析袋内无机盐等小分子物质降低到最小为止。
超过滤:根据蛋白质无法通过半透膜的性质,利用压力或离心力,弱行使水和其它小分子物质通过半透膜,而蛋白质被留存。
亚基:四级结构中,每个球状蛋白质为亚基(亚单位、单体),亚基可以是一条或多条肽链。
2、表明蛋白质的元素共同组成、分类和生物学功能解:组成:蛋白质由c、h、o、n四种元素组成,多数含有s,有的含有微量铁、铜、锌、碘和磷等元素。
分类:(1)蛋白质分子形状:球状蛋白质、纤维状蛋白质。
(2)蛋白质分子共同组成:直观蛋白质、融合蛋白质。
(3)生物功能:酶、结构蛋白、防卫蛋白等。
生物学功能:做为有机体新陈代谢的催化剂(酶);生物体的结构成分(胶元蛋白);储藏功能(做为生物体养料和胚胎或幼儿生长发育的原料。
);运输功能(血红蛋白);运动功能(肌动蛋白和肌球蛋白);调节功能(激素);参予高等动物的免疫反应(抗体和免疫系统蛋白);掌控或调节遗传物质核酸的促进作用(组蛋白);提供更多能量等。
3、叙述分析蛋白质一级结构的基本流程求解:测量蛋白质中多肽链的数目;分拆蛋白质分子的多肽链,拆分提纯各肽链;拆下多肽链内的二硫键;分析各肽链的氨基酸组成;鉴别多肽链的氨基末端残基和羧基末端残基;用两种相同的水解方式水解多肽链成较小的片段;测量各片段的氨基酸顺序;用片段重叠法扩建完备多肽链的一级结构;确认二硫键的构成方式。
4、说明蛋白质一级结构测定时多肽链的拆分、二硫键的断裂、n-末端分析、c-末端测分析、二硫键位置确定的原理。
求解:多条多肽链共同组成展开分拆:需用8mol/l尿素或6mol/l盐酸胍处置,即可分离。
二硫键的断裂:几条多肽链通过二硫键交联在一起。
可在可用8mol/l尿素或6mol/l盐酸胍存在下,用过量的?-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂(ich2cooh)保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。
可以通过加入盐酸胍方法解离多肽链之间的非共价力;应用过甲酸氧化法拆分多肽链间的二硫键。
n-端氨基酸分析法:(1)二硝基氟苯(dnfb)法;(2)丹磺酰氯(dns)法;(3)苯异硫氰酸酯(ptc)法;(4)氨肽酶法。
c-末端测分析:肼解法、还原法、羧肽酶法。
二硫键边线确认:通常使用胃蛋白酶水解不含二硫键的蛋白质,水解获得的肽段混合物需用brown及hartlny对角线电泳技术拆分。
5、叙述sanger法和edman法进行n-端氨基酸分析的原理求解:sanger法:2,4-二硝基氟苯在碱性条件下,能与肽链n-端的游离氨基促进作用,分解成二硝基苯衍生物(dnp)。
在酸性条件下水解,获得黄色dnp-氨基酸。
该产物能用乙醚裂解拆分。
相同的dnp-氨基酸可以用色谱法展开鉴别。
edman法:多肽或蛋白质的末端氨基能够与pitc促进作用,分解成苯氨基硫甲酰多肽或蛋白质(ptc-多肽或蛋白质),它们在酸性有机溶剂中冷却时,n末端的ptc-氨基酸出现环化,分解成苯乙内酰硫脲的衍生物并从肽链上瓦解。
脱下n末端氨基酸后剩的肽链仍然就是完备的。
重复反应可以用以测量氨基酸顺序。
6、叙述蛋白质在胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶、溴化氰作用下的裂解特点。
解:胰蛋白酶:水解arg、lys的羧基和其他氨基酸(pro除外)氨基形成的肽键。
糜蛋白酶:水解phe,trp,tyr(芳香族氨基酸)的羧基和其他氨基酸(pro除外)氨基构成的肽键。
胃蛋白酶:水解phe,trp,tyr(芳香族氨基酸)的羧基和其他氨基酸(pro除外)氨基形成的肽键。
溴化氰:水解甲硫氨酸的羧基和其他氨基酸(pro除外)氨基构成的肽键。
7、描述维系蛋白各级结构的键。
求解:一级结构:肽键、二硫键。
二级结构:链内或链间形成的氢键。
三级结构:氢键、范德华力、疏水键、离子键(盐键)、二硫键,疏水键就是并使蛋白质多肽链展开卷曲的主要驱动力。
四级结构:非共价键(次级键):氢键、范德华力、亲水性促进作用和盐键(离子键)8、描述α-螺旋的特点和影响α-螺旋构成的因素解:α-螺旋:多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的右手螺旋结构。
α-螺旋的特点:以肽键平面为基本单位,cα为转折点,拖中心轴构成右手螺旋。
a-螺旋是一个棒状结构,紧密卷曲的多肽主链形成棒的内部,侧链向外伸展。
每圈螺旋占3.6个氨基酸残基,沿螺旋轴方向上升0.54nm(螺距)。
每个残基绕轴旋转100°,沿轴上升0.15nm。
氨基酸残基侧链‘r’伸入外侧。
数等侧链,螺旋直径0.5nm。
相连的螺圈之间构成链内氢键,氢键的何人几乎与中心轴平行。