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罗氏第一链cDNA合成试剂盒Transcriptor First Strand cDNA Synthesis Kit 中文说明书

反应次数目录号反应次数04 379 012 00150次,包括10次对照反应04 896 866 001100次04 897 030 001200次试剂盒包装与含量小瓶/瓶盖标签适用于a) 04 379 012 001 b) 04 896 866 001 c) 04 897 030 0011红色TranscriptorReverseTranscriptase(逆转录酶)a) 1瓶,25 μl (20 U/μl)b) 1瓶,50 μl (20 U/μl)c) 2瓶,各50 μl (20 U/ μl)储存缓冲液:200 mM 磷酸钾,2 mM 二硫苏糖醇,0.2% Triton X-100(v/v),50% 甘油(v/v),pH 约为7.2∙2无色Transcriptor RTReaction Buffer(5×)(逆转录缓冲液)a) 1瓶,1 mlb) 1瓶,1 mlc) 2瓶,各1 ml5×浓度:250 mM Tris/HCl,150 mM KCl,40 mM MgCl2,pH约为8.5(25°C)∙3无色ProtectorRNase Inhibitor(RNase抑制剂)a) 1瓶,50 μl(40 U/μl)b) 1瓶,100 μl(40 U/μl)c) 2瓶,各100 μl(40 U/μl)储存缓冲液:20 mM Hepes-KOH,50 mM KCl,8 mM 二硫苏糖醇,50 % 甘油(v/v),pH 约为7.6 (4°C)∙4黄色/ 紫色Deoxynuc-leo-tideMix(dNTP)a) 1瓶,100 μl(黄色瓶盖)b) 1瓶,200 μl(紫色瓶盖)c) 2瓶,各200 μl(紫色瓶盖)dATP, dCTP, dGTP, dTTP各10 mM∙5蓝色Anchored-oligo(dT)18Primer(锚定oligo(dT)18引物)a) 1瓶,100 μl(50 μM)b) 1瓶,200 μl(50 μM)c) 2瓶,各200 μl(50 μM)6Random Hexamera) 1瓶,100 μl(600 μM)蓝色Primer(随机引物)b) 1瓶,200 μl(600 μM)c) 2瓶,各200 μl(600 μM)7绿色Control RNA(对照RNA)a) 1瓶,20 μl(50 ng/μl)包含提取于永生细胞系(K562)的总RNA 片段稳定溶液∙8绿色Control Primer Mix PBGD(对照基因引物)a) 1瓶,40 μl5 μM 人类PBGD特异性正向与反向引物∙9(b和c为瓶7)无色Water, PCR-gradea) 1瓶,1 mlb) 2瓶,各1 mlc) 3瓶,各1 ml注意:货号为04 896 866 001和04 897030 001的产品不含有control试剂(瓶7和瓶8),因此瓶7即为Water, PCR-grade。

储存条件及其稳定性请将该产品存放于-15~-25°C条件中,并于产品标签上的有效期之前使用。

注意:Control RNA(货号04 379 012 001的瓶7)应储存于-70°C条件。

请避免将产品反复冻融!2 产品使用方法2.1 实验前准备样本材料RNA模板:分离的总RNA,mRNA,病毒RNA或体外转录的RNA。

注意:想要得到较好的RT结果,使用高质量完整的RNA(不含基因组DNA残留、RNA酶、抑制剂)是必要的。

请根据以下预防措施进行操作,避免使RNA在分离过程中受到RNA酶的污染(从细胞裂解开始):- 使用RNA酶抑制剂(如Protector RNase Inhibitor)或在使RNA酶失活的分离条件下进行操作。

- 如果有必要,用凝胶电泳分析过程中不同步骤(裂解、分离)以确保样本中不含有RNA酶。

- 请记住RNA酶也可能出现在受到污染的玻璃容器中。

为了准备总RNA或mRNA,我们建议您使用罗氏应用科学部的试剂。

为了筛选出能够产生高质量的适用于RT-PCR的完整RNA模板,请参考第3部分。

补充信息:想了解订货信息或查看相关核酸分离纯化指南,请访问/napure.想了解关于使用MagNA Pure LCSystem或MagNA Pure Compact System进行核酸自动分离的更多信息,请访问.引物六聚物随机引物∙在常规的RT反应中,使用5μg的总RNA 模板,可采用60μM的随机引物终浓度。

使用5μg总RNA并增加随机引物浓度,将增加短片段PCR产物(的产率,但是相应地,长片段PCR产物及全长转录子的产率会降低。

在非特异引物的反转录方法中,随机引物法是最多使用的一种方法,其特异性的扩增产物只能通过后续的PCR反应中使用特异的PCR引物获得。

锚定oligo(dT)18引物∙锚定oligo(dT)18引物特异性地结合在带有poly(A)+的RNA片段上,这类片段通常只占总RNA的1-2%,因此用锚定oligo(dT)18引物进行反转录所获得的cDNA产率大大低于随机引物方法。

如果实验是为了获得新mRNA的RT-PCR产物,则推荐使用锚定oligo(dT)18引物。

使用该方法获得的RT-PCR产物具有较强的一致性。

特异性序列引物∙使用特异性序列引物,其终浓度推荐为2μM。

但是请注意,即使这些引物在以DNA作为模板的PCR反应中成功获得扩增产物,相同的引物序列却可能难以定位在cDNA片段上。

如果遇到此类情况,请使用锚定oligo(dT)18引物重新进行第一链合成反应。

2.2 实验流程标准RT-PCR流程在此提供两种不同的操作流程:A:反转录使用锚定oligo(dT)18引物或六聚物随机引物或特异性序列引物。

在大多数情况下,只选择其中的一种引物进行cDNA合成。

∙B:反转录使用oligo(dT)18引物和六聚物随机引物的混合物。

这种方法可提高反应敏感度,但与使用单一oligo(dT)18引物比起来反应特异性会降低。

∙注意:根据您使用的引物类型,参考以下给出的流程A与B。

流程A:使用锚定oligo(dT)18引物或六聚物随机引物或特异性序列引物合成cDNA。

以下描述的条件适用于两步法RT-PCR的第一链cDNA合成。

图1为单一反应和多重反应中cDNA合成流程概述。

单一反应多重反应RNA+引物+水可选:变性10min 65°C冰上配置多重RT反应混合液(除RNA模板)并分装到各反应管添加模板RNA到每个反应管中置于冰上,添加缓冲液,RNase Inhibitor,dNTPs,Transcriptor RT锚定oligo(dT)18引物/特异性序列引物30min 55°C或1h 50°C六聚物随机引物10min 25°C30min 55°C或1h 50°C85°C失活5min添加1-5 μl至PCR体系或RT-PCR体系准备cDNA合成图1:单一反应和多重反应中cDNA合成流程概述①使用前先将所有冷冻试剂解冻。

∙开始实验前将所有试剂轻度离心。

∙实验开始后保持将所有试剂置于冰上。

∙②将无菌、无核酸酶、薄管壁的PCR管置于冰上,以20 μl反应体系为例,按照以下组分准备模板-引物混合物。

注意:进行与RNA相关的操作时请保持配戴手套。

模板-引物混合物(1次反应) 成分体积最终浓度总RNA或poly(A)+ mRNA1 μg 总RNA或10 ng poly(A)+ mRNA引物- 以下任选其一:Anchored-oligo(dT)18 Primer, 50pmol/μl (瓶5)1 μl2.5 μM 或Random Hexamer Primer, 600 pmol/μl (瓶6)2 μl60 μM或Sequence-Specific Primer 可变0.5-2.5 μMWater, PCR-grade (瓶7或9)可变使总体积为13 μl总体积13 μl以上为初实验的建议浓度。

为了得到合适的模板浓度,需要使总RNA的量在10 ng 到5 μg之间,使mRNA的量在1 ng到100ng之间。

注意:当RNA样本浓度较低(< 10 μg/ml)时,添加10 μg/ml MS2 RNA*以使RNA 模板稳定。

③可选步骤:在65°C条件下加热反应管10min使模板-引物混合物变性。

此步骤可确保RNA 二级结构变性。

∙立即将反应管置于冰上冷却。

∙④在含有模板-引物混合物的反应管中加入下表中其余的RT反应液组分。

成分体积最终浓度Transcriptor Reverse Transcriptase Reaction Buffer, 5×(瓶2)4 μl1×(8 mM MgCl2)Protector RNase Inhibitor,40 U/μl(瓶3)0.5 μl20 UDeoxynucleotide Mix,每种dNTP各10 mM(瓶4)2 μl每种dNTP各1 mMTranscriptor Reverse Transcriptase,20 U/μl(瓶1)0.5 μl10 U最终体积20 μl⑤在反应管中将试剂小心混匀。

∙注意:不要旋涡!将反应管轻度离心使样本收集于反应管底部。

∙反应时使用带热盖的加热模块,防止反应管中的液体挥发。

∙⑥根据您所使用的引物以及目标mRNA的长度,RT反应孵育时间参考下表:使用的引物目标mRNA的长度RT反应孵育时间Anchored-oligo(dT)18 Primer, 50pmol/μl 或Sequence-Specific Primer不超过4 kb55°C下30min超过4 kb50°C下60minRandom Hexamer Primer, 600 pmol/μl不超过4 kb25°C下10min,之后55°C下30min超过4 kb25°C下10min,之后50°C下60min⑦加热至85°C维持5min使Transcriptor Reverse Transcriptase失活。

∙将反应管置于冰上以终止反应。

∙反应管在+2~+8°C下可保存1-2小时,在-15~-25°C下可保存更长时间。

∙⑧此cDNA产物无需经过纯化即可用于PCR反应。

一般来说,使用1-5 μl 第一链cDNA作为模板加入PCR体系中。

若是最初的实验,可尝试在50 μl PCR体系中使用2 μl cDNA作为模板。

∙如果在LightCycler System上进行PCR,在20 μl 的反应体系中使用2-5 μl cDNA或cDNA稀释液。

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