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基因工程实验报告

基因工程实验报告、小麦GAPDH截短体的重组与表达摘要:本实验通过基因工程(genetic engineering)手段对小麦总RNA进行提取、PCR扩增及与质粒载体的重组构建的操作,并将重组质粒以氯化钙法导入大肠杆菌感受态细胞,诱导目的基因表达,并在蛋白水平进行Western检测。

通过本对实验的实践,我们对基因工程技术将会有一个比较全面的认识和了解。

关键字:小麦基因;载体;感受态前言基因工程(genetic engineering)又称基因拼接技术和DNA重组技术。

为在分子水平上对基因进行操作的复杂技术,是将外源基因通过体外重组后导入受体细胞内,使这个基因能在受体细胞内复制、转录、翻译表达的操作。

它是用人为的方法将所需要的某一供体生物的遗传物质——DNA大分子提取出来,在离体条件下用适当的工具酶进行切割后,把它与作为载体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某一更易生长、繁殖的受体细胞中,以让外源物质在其中“安家落户”,进行正常的复制和表达,从而获得新物种的一种崭新技术。

它克服了远缘杂交的不亲和障碍。

(一)实验过程1.实验部分流程:2.小麦总RNA提取(Trizol法)2.1 材料小麦幼苗2.2 试剂配制及器具处理① 0.1%的DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯)②器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和1.5ml和0.2ml 的EP管等用纱布包裹,在0.1%的DEPC H2O中浸泡过夜(37℃),高压灭菌,80℃烘干备用。

剪刀、镊子和药匙等160℃烘烤6h以上。

③无RNA酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃×2h)装蒸馏水,然后加入0.1%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。

④Trizol⑤ 75%乙醇:用新打开的无水乙醇和DEPC处理过的水配制75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。

⑥氯仿(最好用新的)。

⑦异丙醇(最好用新的)。

2.3 操作步骤:①先在研钵中加入液氮,再将小麦叶片剪成小段在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50~100mg组织粉末加入已盛有1ml的Trizol液的EP管中(注意研磨粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。

②室温放置5min,然后加入200µL的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。

③ 12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500µL异丙醇,温和颠倒混匀。

室温放置10min,12000rpm 离心10min。

④小心地弃去上清液,加入1ml的75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。

⑤重复步骤④。

⑥弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥5~10min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。

用30µL DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴10min。

RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。

3. RT-PCR扩增目的基因cDNA3.1 试剂① RNA模板②Olig(dT)18③反转录缓冲液④dNTP⑤ M-MULV反转录酶⑥ RNA抑制剂(RNasin)⑦Premix EX Taq DNA聚合酶⑧ PCR特异引物3.2操作步骤:3.2.1 RNA的反转录采用Thermo Scientific(Fermentas)RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit Total RNA 6µL(需加入RNA约1μg)OligodT primer 1µLH2O(nuclease-free)5µL12µL65℃ 5min,补加下列试剂:5× Reaction buffer 4µLRibolockRNase Inhibitor 1µL10mM dNTP Mix 2µLRevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase 1µL20µL42℃ 60min70℃,5min,﹣20℃保存3.2. 2 PCR 扩增目的基因用表达引物扩增目的基因(25µL 体系)2×PCR Mix 12.5µL 95℃ 1min95℃ 10s 58℃ 20s 72℃ 45s 72℃ 10min 16℃∞cDNA 1µL 引物GA22PDH1-1 1µL 引物GAPDH1-2 1µL H 2O 9.5µL total 25µLPCR 产物经胶回收。

4.核酸琼脂糖电泳分析 4.1 试剂① TAE 缓冲液(50×):用时需稀释50倍 ② 点样缓冲液Loading buffer (10×):含0.25%溴酚蓝和40%甘油 ③ 溴乙啶染色液(EB):10mg/ml 溴乙啶,注意EB 具致癌作用。

④ 琼脂糖 4.2 操作步骤4.2.1 琼脂糖凝胶的制备称1g 琼脂糖加入100ml TAE 缓冲液中加热熔化。

4.2.2 胶板制备将凝胶槽清洗干净,在一端插好梳子。

然后倒入熔化好的琼脂糖,待凝胶完全凝固后,将凝胶槽移至电泳槽(槽中已加入TAE 缓冲液),拔掉梳子。

注意:缓冲液要高出胶面2mm 。

4.2.3 点样每个样品中加入1/10体积Loading buffer (10×),混匀后小心地加入点样孔中,要避免相互污染。

4.2.4 电泳接通电源,80V 电压电泳40min 左右,当溴酚蓝到达凝胶前沿约2㎝处时停止电泳。

4.2.5 观察及照相将凝胶取出,在EB 溶液中浸泡10min 后,用凝胶成像系统照相。

5.pGEX 4T-1质粒的提取5.1 实验材料含质粒的大肠杆菌 5.2 试剂质粒提取试剂盒(天根生物科技)35cycles5.3操作步骤5.3.1培养细菌将带有质粒的大肠杆菌接种于 LB 平板培养基上,37℃培养 24 h,然后从平板上挑取单菌落,接种于 5 mL 液体培养基中,37℃培养 12 h。

5.3.2提取步骤①柱平衡步骤:向吸附柱 CP3 中(吸附柱放入收集管中)加入 500µL 的平衡液 BL,12,000rpm(~13,400×g)离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

(请使用当天处理过的柱子)②取1-5 mL过夜培养的菌液,加入离心管中,使用常规台式离心,12,000rpm(~13,400×g)离心 1min,尽量吸除上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。

③向留有菌体沉淀的离心管中加入 250µL 溶液 P1(请先检查是否已加入 RNaseA),使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌沉淀。

④向离心管中加入 250µL 溶液 P2,温和地上下翻转 6-8 次使菌体充分裂解。

⑤向离心管中加入 350µL 溶液 P3,立即温和地上下翻转 6-8 次,充分混匀,此时将出现白色絮状沉淀。

12,000rpm(~13,400×g)离心 10min,此时在离心管底部形成沉淀。

⑥将上一步收集的上清液用移液器转移到吸附柱 CP3 中(吸附柱放入收集管中),注意尽量不要吸出沉淀。

12,000rpm(~13,400×g)离心 30-60 sec,倒掉收集管中的废液,将⑦吸附柱 CP3 放入收集管中。

⑧向吸附柱 CP3 中加入 600µL 漂洗液 PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~13,400×g)离心 30-60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱 CP3 放入收集管中。

⑨重复操作步骤 7。

⑩将吸附柱 CP3 放入收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心 2min,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。

⑪将吸附柱 CP3 置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位滴加 50-100µL 洗脱缓冲液 EB,室温放置 2 min,12,000rpm(~13,400×g)离心 2min 将质粒溶液收集到离心管中。

5.3.3琼脂糖凝胶电泳法检测提取的质粒DNA6表达载体和目的片段的酶切6.1试剂①BamHⅠ②SalⅠ③BamHⅠ buffer④质粒提取试剂盒6.2操作步骤6.2.1在 LB 液体培养基中接入带pGEX 4T-1 质粒的菌种,在 37℃下 200rpm 摇菌过夜。

参见实验 8 的方法提取质粒。

7载体和外源 DNA 的连接反应7.1试剂①目标 DNA 片段(PCR 扩增产物)②载体(pGEX 4T-1 酶切回收产物)③10×ligation 缓冲液④T4 DNA 连接酶⑤ddH2O7.2操作步骤8感受态细胞的制备及转化8.1实验材料大肠杆菌 Top 10 或 BL21(DE3)PlysS8.2试剂① LB 培养基(液体和固体培养基配置方法参见附录 2)②氨苄青霉素8.3操作步骤8.3.1感受态的制备①从 LB 平板上挑取单克隆于 5ml LB 培养基中,37℃ 200rpm 摇菌 12~16h。

②将活化过的菌按 1~5%的体积比接种到新的 LB 液体培养基中,37℃ 200rpm 摇菌约 2h,OD 600 约为 0.4。

③取 1.5ml 摇好的菌液于一个1.5ml 的 EP 管中,4℃4000rpm 离心 3min,弃上清。

④加 250µL 0.1M 的 CaCl2(灭菌预冷)温和悬浮菌体,4℃ 6000rpm 离心 1min 弃上清。

⑤加 200µL 0.1M 的 CaCl2(灭菌预冷)温和悬浮菌体,即为感受态细胞。

置于 4℃存放。

12h 内使用效果最佳。

注意:无菌操作和保持低温。

培养物处于对数生长期是制备感受态细胞的关键。

如果要求高转化效率,不建议使用简单深冻保存的感受态细胞。

8.3.2转化①将盛有感受态细胞的 EP 管放置于冰上 10min,加入 10µL 连接产物(若加质粒,则只需加 1µL),温和混匀,冰浴 20~30min。

②42℃热激 90S。

冰浴 5~10min。

③加入 800µL LB 液体培养基,37℃培养 45~60min。

4000rpm 离心 2min,弃去800µL 上清液,剩余混匀用来涂板。

④取含有 50~100g/ml Amp 的 LB 平板培养基(若进行蓝白斑筛选,在培养皿上先涂布 4µL 200mg/ml 的 IPTG 和 40µL 20mm/ml 的 X-Gal),涂板。

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