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DNA文库的构建精

? 2.高质量大分子量基因组 DNA 的提取践表明,提取的 基因组 DNA 分子量越大,所得到到的 28SrRNA条带的亮度约为 18SrRNA条 带亮度的两倍,说明 RNA样品完整,降解不多,如果两条带 的亮度反过来,说明部分 28SrRNA已降解;如无清晰条带, 表明样品己严重降解。
mRNA的富集对低丰度mRNA显得特别重要。
2)第一链 cDNA 合成 由mRNA到cDNA的过程称反转录,由反转录酶催化。 反转录酶:依赖RNA的 DNA聚合酶,需要引物 反转录引物:oligo(dT)引物和随机引物(不能产生 完整的cDNA)
体在体外重组后,转化宿主细胞,并通过一定的选择 机制筛选后得到大量的阳性菌落(或噬菌体),所有 菌落或噬菌体的集合即为该生物的基因。外源DNA片断、载体、宿主
? 构建基因的基本程序:(1)提取研究对象基因组 DNA,制备合适大小的 DNA 片断,或提取组织或器官的 mRNA并反转录成 cDNA,
2)表达量的差异决定构建 cDNA要具有合适的容量。 3)mRNA的丰度 高丰度mRNA:5000多个拷贝,占总 mRNA的22% 中等丰度mRNA:200-300 个拷贝,占总 mRNA的49% 低丰度mRNA :1-15个拷贝,占总 m数目,
Clark和Carbon公式:
N=ln(1-p)段的大小和基因组 DNA 大小
的比值
例:哺乳动物基因组:3×109 Kb p:=99%
一般覆盖倍数达到是基因组的 某一区段,如基因组某一特定大小酶切片段的组合, 一条染色体或更小的区段(如一个 YAC或BAC克隆 等)。
例如:将基因组 DNA用多种限制性 内切酶切割, Southern杂交
显示目标基因在 8.3kb的Spel片段上
则可将Spel酶切的 基因组DNA中或这一时期的特殊组织。
根 叶 花 花药 茎 穗下节cDNA 第一链的合成、c的基因组DNA或cDNA片段取和 mRNA 分离; 第二,第一链 cDNA 合成; 第三,第二链 cDNA 合成; 第四,双链 cDNA 克隆进质粒或噬菌体载体
并导入宿主中繁殖。

1)mRNA的完整性及mRNA的富集
通常是根据28sRNA和18sRNA条带的亮度判断RNA的 完整性,间接判断mRNA的完整性。
(2)DNA片段或cDNA与经特殊处理的载体连接形成 重组DNA,
(3)重组DNA转化宿主细胞或体外包装后浸染受体 菌,
(4)阳性重组菌落或噬菌斑的选择。基因组DNA基因cDNA
基因组与cDNA最大的区别在于cDNA具 有时空特异均插入片段大小20kb
f= 20Kb/3×109 Kb
N=ln(1-p)/ln(1-f) =690构建程序包含 5 个部分:
? ① 载体的制备; ? ② 高纯度大分子量基因组 DNA (High molecular weight
DNA, HMW DNA )的提取; ? ③ HMW DNA 的部分酶切与脉冲电泳分级分离( PFGE size
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱselection); ? ④ 载体与外源片段的连接与转化或侵染宿主细胞; ? ⑤ 重组克隆的挑取高;二是去磷酸化好。
? 寻找最适的载体与基因组之间的 比例。 ? 首先最好选择转化效率高的进口感受态细胞或效价
高且质量稳定的包装蛋白, ? 对于电转化而言,选择合适的转化电压对不同插入
片段的 DNA合成
氢氧化钠消化杂合双链中的 mRNA 链 第一链 cDNA 的 3'-末端就会形成一个发夹环 合成第二链 cDNA S1 核酸酶消化连接处
自身引导法合成 cDNA第二链
常用方法
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