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分子克隆PPT课件

变性
95˚C
延伸 70-75˚C
退火
Tm-5˚C
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P1 第 一 次 循 环
94℃ 72℃
Taq DNApol.
P2
(35-65℃)
94℃
第 二 次 循 环
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PCR技术最关键的两步
• 引物的设计 引物必须相应于模板分子相邻的序列,引 物序列于对应的模板连应该是互补而不是 相同的,这样杂交才会发生且杂交后的引 物的3‘末端应该对着另一条引物的3’末 端。最重要的是引物的长度,因为引物的 长度影响其杂交到模板DNA上去的效率,引 物越长杂交所需的时间越长;引物太短可 能与目标位点以外的位点相杂交,而扩增 出我们并不需要的产物
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噬菌体载体
λ噬菌体 一种典型的头-尾结构,双链线状DNA分子,全长50kb,含66个基 因,在其分子两端各含有12个碱基的互补单链,是天然的粘性末 端,被称为COS位点
M13噬菌体
一种典型的纤维状结构,其DNA分子相比λ噬菌体要小的多,长度 仅6407个核苷酸,通常为环状双链DNA
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λ噬菌体结构
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2019/9/19
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• 退火温度 温度太高,不会有杂交发生引物与模板仍 然相互分离;温度太低,又会有稳定的错 误配对发生。退火温度有引物-模板杂交结 构的解链温度(Tm)决定,Tm是指正确的碱 基配对杂交结构相互分开的温度 Tm={(4*[G+C])+(2*[A+T])}˚C
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DNA操作酶
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重组DNA导入宿主细胞的类型
转化:以质粒作载体构建的重组体 导入受体细胞的过程
类 转染:以病毒作载体构建的重组体 型 导入受体细胞的过程
转导:以噬菌体作载体构建的重组 体导入受体细胞的过程
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• 感受态细胞 受 体 细 胞 经 过 一 些 特 殊 方 法 ( 如 CaCl 、 RuCl等化学试剂法)的处理后,细胞膜的 通透性发生变化,成为能容许多有外源DNA 的载体分子通过的细胞
dNTP为原料,按碱基配对方式,从 杂交链中的RNA ⑶ 以DNA为模板,
5’-3’ 方 向 合 成 新 的 DNA 链 。 催化合成cDNA双链
TaqDNA聚合酶在70~75℃时具有最
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佳的生物活性
DNA重组技术
分—获取目的基因和载体 接—目的基因与载体的连接 转—重组DNA导入宿主细胞 筛—重组DNA的筛选与鉴定
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有时还要求载体要能启动外源 基因进行转录及表达,并且尽 可能是高效的表达
载体的特性
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从安全角度考虑,要求载体不 能随便转移,仅限于在某些实 验室内特殊菌种内才可复制
6 有适合的标记,易于选择
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克隆载体
1 质粒载体 2 噬菌体载体 3 酵母菌质粒载体 4 动植物病毒载体
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质粒载体
• 质粒是一种独立于染色体外的小分子环状DNA,一 般大小约为数千碱基对,可自身复制和表达,有 的质粒还带有可做 为选择性标记的抗 药性基因,所以质 粒经过适当改选后 便可成为良好的载 体
分子克隆
报告人:
LOGO
1
C
o
克隆载体
n
t
PCR技术
e
n
DNA操作酶 LOGO
t
s
DNA重组技术
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分子克隆
• 分子克隆(基因克隆、DNA重组技术) 通过体外重组技术,将一段目的DNA经切割、 连接插入适当载体,并导入受体细胞,扩 增形成大量子代分子的过程。分子克隆的 核心是:体外重组即人工将一段目的DNA插 入一个载体的过程
A 限制性内切酶
是一类由细菌产生的能专一识别和 切割双链DNA中的特定碱基序列的 核酸内切酶,简称限制酶或切割酶。 根据限制酶作用特性,一般分为Ⅰ、 Ⅱ和Ⅲ型,其中常用的是Ⅱ型限制 酶
B T4DNA连接酶
催化双链DNA中一条链的3ˊ-OH与 另一条链的5ˊ-PO3H2形成磷酸二 酯键,从而构成完整的DNA长链
• 它本身是一种核蛋白,核心是一段DNA,结构上有 一个蛋白质外壳和尾巴,尾巴上的微丝可以把噬 菌体的DNA注入细菌内
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cos位点的作用
• cos位点在λ噬菌体侵染周期中起着两种截 然不同的作用
使已经注入细胞的线性DNA分子闭合成环,这是使噬菌体 DNA分子插入细菌基因组的必要先决条件
当前噬菌体被从宿主细胞中切除后,此时其作为一个限制性 内切核酸酶的识别序列
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λ噬菌体的侵染模式
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M13噬菌体的侵染过程
• M13以纤毛吸附大肠杆菌,并向其注入自身DNA
单链DNA注入宿主细胞后,合成第二条链(双链复 制模式 RF)
RFDNA拷贝数达到100~200个后 ,通过滚环复制机 制产生线状单链DNA
包装成为成熟的噬菌体颗粒并从细菌体内溢出

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PCR的基本反应步骤
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分子克隆的路线
载体DNA (vector)
重组DNA (recombinant DNA )
目的DNA DNA 重组
(target fragment)
转化
宿主(host)
筛选、扩增
克隆(clone)
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载体的特性
1
分子较小,可携带比较大的DNA片段
2
能独立于染色体而进行自主 复制并且是高效的复制
3 要有尽可能多种限制酶的切 割位点,但每一种限制酶又 要最少的切割位点
C TaqDNA聚合酶
D 逆转录酶
TaqDNA聚合酶是一种依赖DNA的单 逆转录酶是一个多功能性酶,至少
亚基耐热DNA聚合酶, 主要用于聚 具 有以下 3种酶 活性: ⑴ 以单 链
合酶链式反应中,能以DNA为模板, RNA为模板,催化合成cDNA单链 ⑵
从 结 合 在 模 板 上 的 引 物 出 发 , 以 具有 RNaseH活性 ,能水解 RNA:DNA
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目的基因的来源
Con 制备基因组DNA ten ts
聚合酶链反应
目的基因 来源
Con 制备cDNA ten ts
人工合成基因

.
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目的基因与载体的连接
粘性 末端 连接
平头 末端 连接
人工 接头

同源多 聚尾连 接法
将目的基因和 载体用同一种 限制酶酶切, 产生相同粘性 末端,再通过 DNA连接酶作 用将两者连接 起来,构成重 组DNA分子
有些限制酶 只能将目的 基因和载体 DNA切割成平 端,此时在 T4DNA连接 酶的作用下 同样能连起 来。
合成连接子 →与DNA平 头末端连接 →限制酶切 割,产生粘 性末端→连 接,构建重 组DNA。
2019/9/19
可编辑
要求DNA分子内 部必须完整, 即两个DNA链间 不存在缺口; 否则末端脱氧 核苷酸转移酶 也会在3’-OH 上加入多聚尾 巴,破坏了DNA 分子活性
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