分子生物学基本技术介绍
操作
• 离心机分类:普通 6000rpm 高速 20000-25000rpm 20000超速 30000-80000rpm 30000• 平衡 • 温度-离心力-转速 温度-离心力• 转头:角转,平转,垂直转
三 凝胶电泳技术
原理
• 等电点:DNA pI=6.0-7.0 等电点:DNA pI=6.0• 琼脂糖-PAG:支持介质 琼脂糖-PAG:支持介质 • U=V/E=(d/t)/(v/l) U=V/E=(d/t) v/l) =Q/(6 π rη)
电泳影响因素
• 1. DNA物理性质 DNA物理性质
质粒: CC>L >OC CC> 线பைடு நூலகம்:㏒10M 正比 1/m
• 2. 介质性质
㏒10U= ㏒10U0-KrT 分离范围:agrose:100bp分离范围:agrose:100bp-60kb PAG: PAG:5-500bp
• 3. 电压:5v/cm 电压:5v/cm • 4. 缓冲液:TAE,TBE,TPE 缓冲液:TAE,TBE,
方法
样品+ 样品+等体积饱和苯酚 10kb以上轻柔混匀;10kb以下振荡 10kb以上轻柔混匀;10kb以下振荡 离心(12000*g) 离心(12000*g) 取上清
核酸相 Protein变性相 Protein变性相 有机相
二 离心技术
原理
• 离心力:F= ω 2rm 离心力:F= RCF=F/G= ω 2r/g =(2π * rpm)2r/g rpm) =1.119*10-5(rpm)2r • 浮力密度:K=m-mp0/p 浮力密度:K=m• 沉降阻力:f*(dx/dt) 沉降阻力:f*(dx/dt) • RCF=k+ f*(dx/dt) 差速离心— 差速离心—密度梯度离心
任
务
• 采集植物叶片 • 1. 植物的科, 种, 属 植物的科, • 2. 取幼嫩叶片0.8克(中午) 取幼嫩叶片0.8克 中午) • 3. 清洗干净, 擦干水分!? 清洗干净, 擦干水分!?
结构类结构类-细胞碎片,细胞器,其他 大分子-DNA,RNA,Protein,糖类,脂类等 大分子-DNA,RNA,Protein,糖类,脂类等 小分子小分子-氨基酸,小分子糖类和脂类,水,无机物等 • 2. 关键: DNA,RNA—Protein 关键: DNA,RNA—
• 3. 方案: Protein变性 Protein变性
• 纯度:OD260/OD280=1.6-1.8 =1.6-
五 分子杂交技术
六 序列分析技术
作业
• 1. 市售苯酚为什么要饱和与重蒸? • 2. 离心操作应该注意哪些问题? • 3. 如果要分离470bp和5kb DNA 应该选择 如果要分离470bp和 什么凝胶? • 4. 在核DNA定量时,取10uL DNA待测液, 在核DNA定量时,取10uL DNA待测液, 用TE buffer 稀释到100uL 后,加入到 稀释到100uL 0.5cm的石英比色皿中。OD 测定为0.21, 0.5cm的石英比色皿中。OD260测定为0.21, 问DNA待测液的浓度是多少? DNA待测液的浓度是多少? • 5. 简述DNA序列分析的基本原理。 简述DNA序列分析的基本原理。
苯酚:强变性 25 氯仿:弱变性 24 异戊醇:消泡 1
• 4. 苯酚的处理:重蒸-饱和-pH 苯酚的处理:重蒸-饱和重蒸:去除醌类氧化物 饱和:防止核酸损耗 pH: pH7.0-8.0-核酸最适合 pH: pH7.0-8.0方法:蒸馏(183℃ 收集(棕色瓶)方法:蒸馏(183℃)-收集(棕色瓶)-饱和与调 pH(Tris-HCl pH8.0)-0.1%8羟基喹啉- 4 ℃或pH(TrispH8.0) 0.1%8羟基喹啉20 ℃保存
四 核酸定量技术
原理
• A= ㏒10(1/T) 10(1/T)
= abc
• 浓度:稀溶液(A-0.05-1.0)+ b=1cm 稀溶液(A 0.05-1.0)
DNA: DNA:1OD260=0.05ug/ul RNA: RNA:1OD260=0.04ug/ul dsDNA: dsDNA:1OD260=0.033ug/ul
实验基本技术
分子生物学部分
存在问题
• 1. 基本的实验技能 • 2. 实验习惯 • 3. 责任感和安全性
• • • • • • •
核酸纯化技术 离心分离技术 凝胶电泳技术 核酸定量技术 分子杂交技术 序列分析技术 ………………
一 核酸纯化技术
原理
• 1. 核酸混合物成分: 核酸混合物成分: