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分子生物学的应用技术+


3) PCR 特异性引物、模板、Taq 聚合酶。
通过PCR,将目的片段扩增几十—百万倍。
在一定范围内和一定的条件下,PCR的产物量 与模板量呈正比关系。
产物量
模板量 循环次数
4)几个注意问题:
反应平台 内参
1、PCR效率差异,重复性 2、内参选定 3、共同扩增 4、扩增片段长度 5、mRNA丰度,目标片段与内参片段
Northern blot 特点:
优点:
因为没有扩增过程,Northern blot 的结果可靠性高。 可以确定未知基因的转录产物(mRNA)长度。
缺点:
1、操作烦琐 2、同位素 3、灵敏度低 4、对RNA质量要求高 5、不能定位细胞
3、Western blot
标记抗体与膜固相蛋白作用。 根据信号强弱判断蛋白表达强度。 根据信号位置判断蛋白分子量。
基因表达
基因表达指基因组中某基因在细胞中 转录为mRNA和翻译成蛋白质的过程。
DNA
RNA
Protein
转录
翻译
基因表达的改变预示着细胞在分子水平 上的变化。它往往是细胞形态功能变化之 前的变化。
影响基因表达的因素:
1、遗传因素 个体差异,终生不变。
2、环境因素 激素、药物,细胞因子、机械刺激、 病原体感染、电刺激、细胞转化…..
5、基因芯片
特定载体上密集的大量探针与荧光标记 的样品反杂交。 根据杂交信号强弱判断基因表达强度。
基因芯片特点:
优点: 一次杂交可以得到大量表达信息。通用 性好。
缺点: 成本高,需要专门设备。
结束语
人类基因组计划揭示了人类有3—4 万个基因,转录本多达10万个。基因不 同时空表达是细胞结构和功能的基础; 是组织、器官和系统发育和分化的基础; 也是大多数细胞病变的基础。了解不同 状态下的基因表达调节机制是后基因组 时代的主要任务,是探索生命本质的重 要环节。
iNOS (诱导型一氧化氮合酶) GAPDH (磷酸甘油醛脱氢酶)
5) PCR产物量的测定
应用图象分析软件进行密度测定。
= 目标带密度-背景密度
内参带密度-背景密度
相对量
= 处理后样品相对量 变化率
处理前样品相对量
160% 100%
AB
2.0
2.0
2.0
1.0
CD
2.0
1.0
2.0
1.0
RT-PCR特点:
优点: 灵敏度高、特异性高、操作简便。
缺点: 可靠性差、不能细胞定位。
2、Northern blot 标记探针与膜固相RNA杂交。 根据杂交信号强弱判断表达量, 根据杂交信号位置判断分子长度。
杂交信号
实验操作:
1)RNA提取 2)RNA电泳(分离不同长度RNA) 3)转膜 (形成固相RNA) 4)探针标记(同位素/非同位素) 5)预杂交,杂交 6)洗膜 7)显影(放射性/酶促)
标准分子量 蛋白
特异性反应带
实验操作:
1)蛋白提取 2)蛋白电泳(分离不同分子量蛋白) 3)转移 4)封闭 5)一抗作用 6)标记二抗(HRP/AP标记)作用 7)显色
Western blot 特点:
优点: 直接检测蛋白质的表达量。
缺点: 灵敏度低 一抗制备难度大,购买价格高 容易出现交叉反应 不能细胞定位
研究基因表达的手段
1、RT-PCR (RNA) 2、Northern blot (RNA) 3、Western blot (蛋白质) 4、免疫组化 (蛋白质)
原位杂交、点杂交、RNA酶保护试验
基因芯片
1、RT-PCR
基本原理: 将细胞中mRNA逆转录为cDNA,以cDNA 为模板,进行PCR反应。根据PCR产物的 量,判断基因表达的强度。
谢谢
谢谢观赏
mRNA
cDNA
PCR产物
RT-PCR是一种半定量方法
实验操作:
1)RNA提取:Trizol 试剂盒。
防止RNA降解
RNA提取的成功与否 是RT-PCR检测中最 重要的步骤。
2)逆转录: RNA、缓冲液、dNTP、逆转录酶、 引cDNA
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4、免疫组化
标记抗体与组织细胞作用。 根据信号强弱判断表达强度, 根据信号位置判断表达细胞。
(对照) eNOS表达
(实验)
实验操作
1)组织切片(石蜡/冰冻) 2)封闭,内源性过氧化物酶失活 3)一抗作用 4)二抗(HRP标记)作用 5)显色 6)复染,封片
免疫组化特点: 优点: 细胞定位
缺点: 定量不准确,人为因素干扰大 (图象分析系统)
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