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第六章重组体的筛选与鉴定.ppt
一、根据载体表型特征的筛选 (一)抗药性标记插入失活筛选法
1.以pBR322质粒为例
(2)筛选重组体的原理
在Ampr和Tetr这两个基因内的任一插入作用, 都会导致Ampr基因或Tetr基因出现功能性失活, 于是,所形成的重组质粒都将具有AmpsTetr或 Amprtets的表型。
当外源DNA片段插入pBR322质粒DNA的BamHⅠ或 SalⅠ位点时,抗四环素基因失活(Tetr Tets ),重 组体转化子必定具有AmprTets表型。因此,将转化菌 先涂布在含有Amp的琼脂平板上,并将存活的Ampr菌 落原位影印到另一个含有Tet的琼脂平板上,凡是在 Amp平板上生长,而不在Tet平板上生长的菌落,就必 定是已经插入了外源DNA片段的重组质粒转化子克隆.
在实际操作中,最典型的方法是使用抗药性标记的插 入失活作用,或是β-半乳糖苷酶基因的显色反应,将重 组体DNA分子的转化子同非重组的载体转化子区别开来. 而对于λ噬菌体的置换型载体来说,λ噬菌体头部外壳蛋 白容纳DNA的能力是有一定限度的。其包装能力应控 制在野生型λDNA长度的75%-105%之间(36-51kb),这 样才能形成噬菌斑。因此,包装限制这一特性,保证了 体外重组所形成的有活性的λ重组体分子,一般都应带 有外源DNA的插入片段,噬菌斑的形成本身就是λ重组体 的一种筛选特征。由于这些方法都是直接从平板上筛选, 所以又称为平板筛选法。
➢ 常用的重组子筛选和鉴定方法
直接 筛选
重组 子的 筛选
DNA 鉴定
• 重组子大小的鉴定(质粒DNA的快速提取鉴定) • 重组子酶切图谱鉴定(限制性核酸酶酶切片段
大小鉴定)
• DNA序列分析 • 同源性分析鉴定(原位杂交)
载体 筛选
• 质粒载体的抗性标记筛选 • 噬菌体包装容量的正性筛选 • 质粒载体的α互补筛选(蓝白色斑筛选法) • 标记补救筛选
一、根据载体表型特征的筛选 (一)抗药性标记插入失活筛选法 检测外源DNA插入作用的一种通用方法是插入失活效应。
1.以pBR322质粒为例
(1)pBR322质粒的一般特性 在pBR322质粒上有两个抗生素基因,Ampr基因内有
一个PstⅠ限制性核酸内切酶的唯一识别位点,Tetr基 因内有BamHⅠ和SalⅠ两种限制性核酸内切酶单一识别 位点。
间接 筛选
• 翻译产物(Western blot) • 转录产物(Norther blot) • 其他方法(报告基因)
第一节 遗传学检测法 一、根据载体表型特征的筛选
根据载体分子所提供的表型特征,选择重组体DNA 分子的遗传选择法,可适用于大量群体的筛选,因此是 一种比较简单而又十分有效的方法。在基因工程中使 用的所有载体分子,都至少含有一个选择标记。质粒常 有抗生素抗性基因,如氨苄青霉素抗性基因(Ampr)、 四环素抗性基因(Tetr)、卡那霉素抗性基因(Kanr) 根据载体分子所提供的选择性标记进行筛选,是获得重 组体DNA分子必不可少的条件之一。
β-半 乳糖苷 透过酶
β-半乳糖 苷乙酰基 转移酶
一、根据载体表特征的筛选 (二)β-半乳糖苷酶显色反应筛选法
2.β-半乳糖苷酶显色反应筛选法原理 有许多质粒载体具有β-半乳糖苷酶显色反应的检
测功能.
应用这些载体系列,当外源DNA插入到它的lacZ基 因上时,可造成β-半乳糖苷酶的失活效应,就可通过 大肠杆菌转化子菌落在添加X-gal-IPTG培养基中的颜 色变化鉴别出重组子和非重组子。
在各自独立的情况下,pUC质粒和大肠杆菌编码的 β-半乳糖苷酶片段都没有活性。
一、根据载体表特征的筛选 (二)β-半乳糖苷酶显色反应筛选法
3. 举例 当质粒转化大肠杆菌后,可形成具有酶活性的蛋白
质,它在生色底物X-gal的存在下被IPTG(异丙基-β-D硫代半乳糖苷)诱导形成蓝色菌落。当外源片段插入 到pUC质粒的多克隆位点上后,则会导致读码框架改 变,表达蛋白失活,因此,在同样条件下含重组质粒 的转化子在生色诱导培养基上只能形成白色菌落。因 此,根据这种β-半乳糖苷酶的显色反应,可将重组质 粒与自身环化的载体DNA分开。
•载体和一个或数个串联目的基因连接 •载体发生自连 •目的DNA分子发生自连 •未发生连接反应的载体和目的DNA片段(更
➢ 为什么对重组子要进行鉴定筛选?
因此,在成千上万个转化子中,真正含有期望的 重组DNA分子的比例很少,为了将含有外源DNA的宿 主细胞和不含外源DNA的宿主细胞分开,以及将含有 正确重组子的宿主细胞和含有其他外源DNA的宿主细 胞分开,就需要设计出最易于筛选重组子克隆的方 案并加以验证。
AmprTetr
AmprTets
菌落原位影印
Amp琼脂平板
Tet琼脂平板
图 应用抗生素抗性基因插入失活筛选重组体
一、根据载体表特征的筛选
(二)β-半乳糖苷酶显色反应筛选法1.乳源自操纵子的结构RNA聚 合酶
PI lacI PZYA lacO lacZ lacY lacA
mRNA
mRNA
阻遏蛋白
β-半乳 糖苷酶
第六章 重组体的筛选与鉴定
将目的基因与载体连接形成重组子,然后通过各种 方法将重组子导入宿主细胞,得到所需要的带有重组 DNA的转化子是基因工程的目的所在.
➢ 何谓转化子?
所谓转化子就是导入外源DNA后获得了新的遗传标 志的细菌细胞或其他受体细胞.
➢ 为什么对重组子要进行鉴定筛选?
在转化反应中,并非所有的细胞中都转入重组DNA 分子,即使所有的受体细胞都变为转化体,所获得的转 化子仍是多种类型的DNA分子,原因是在连接反应中会 有以下几种情况发生:
同样,在pBR322质粒的Ampr基因序列中,利用PstⅠ 限制性核酸内切酶识别位点,插入外源DNA片段,也
能应用插入失活作用检测重组质粒,当然,所挑选 如下图所示
的菌落就应该是具有AmpsTetr的表型
一、根据载体表特征的筛选 (一)抗药性标记插入失活筛选法
Ampr pBR322 Tetr
pBR322 + pBR322
一、根据载体表特征的筛选 (二)β-半乳糖苷酶显色反应筛选法
3.举例 pUC质粒:带有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控
序列和β-半乳糖苷酶N端146个氨基酸的编码序列。这 个编码区中插入了一个多种限制性核酸酶单一识别位 点的多克隆位点,但并没有破坏lacZ的阅读框架。
大肠杆菌菌株:带有β-半乳糖苷酶C端部分序列的 编码信息。